RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480452.5

DSCR3-208, Transcript of Down syndrome critical region protein 3, human

TSL 2

Gene DSCR3, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DSCR3-208	ENST00000480452	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	PRR23A	A6NEV1	266 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	CLTB	P09497	229 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	SLC5A1	P13866	664 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	GSE1	Q14687	1217 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	FBXW7	Q969H0	707 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	MSRA	Q9UJ68	235 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	NUBP1	P53384	320 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	TLE2	Q04725	743 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	NEUROD2	Q15784	382 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	TOX2	Q96NM4	488 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	STK25	O00506	426 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	PDE8A	O60658	829 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	KLRK1	P26718	216 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	NBL1	P41271	181 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	NEUROD1	Q13562	356 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	MORN1	Q5T089	497 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	MFSD5	Q6N075	450 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	CCDC174	Q6PII3	467 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	PNMA3	Q9UL41	463 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DSCR3-208	ENST00000480452	SPTBN2	O15020	2390 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	TIMP1	P01033	207 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	RAG1	P15918	1043 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	CYP2B6	P20813	491 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	MRI	Q9BWK5	157 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	WDR70	Q9NW82	654 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	MAP3K10	Q02779	954 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	DCTN1	Q14203	1278 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	CCL14	Q16627	93 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	ST3GAL2	Q16842	350 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	APBA2	Q99767	749 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	TBX21	Q9UL17	535 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	SI	P14410	1827 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	PTPRS	Q13332	1948 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452		F8W031	263 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	KRT38	O76015	456 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	HOXC6	P09630	235 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	PTPRA	P18433	802 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	RGS2	P41220	211 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	ZP2	Q05996	745 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	EDA	Q92838	391 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	RMDN1	Q96DB5	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	PANK3	Q9H999	370 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DSCR3-208	ENST00000480452	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		7.31	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms