RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 HAX1O00165 279 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 LRIG2O94898 1065 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 EOMESO95936 686 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 DLATP10515 647 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 NOS3P29474 1203 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 CTAG1AP78358 180 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ROM1Q03395 351 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 TCF15Q12870 199 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 C19orf35Q6ZS72 473 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ERMP1Q7Z2K6 904 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 CLNKQ7Z7G1 428 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 KIR2DL5AQ8N109 375 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 WASF1Q92558 559 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 GLG1Q92896 1179 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 CTAGE1Q96RT6 745 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 RUFY1Q96T51 708 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF747Q9BV97 191 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 CRISPLD1Q9H336 500 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 FOXJ2Q9P0K8 574 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 SLC8A2Q9UPR5 921 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 LOC285556D6RIA3 1793 aa-1.32□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 WASHC1A8K0Z3 465 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 WASH3PC4AMC7 463 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 CDKL5O76039 1030 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 DLGAP3O95886 979 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF688P0C7X2 276 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 LPOP22079 712 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 COL8A2P25067 703 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 IREB2P48200 963 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 PTH2RP49190 550 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 RELBQ01201 579 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 RING1Q06587 406 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 MST1LQ2TV78 715 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 VAX1Q5SQQ9 334 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF787Q6DD87 383 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 WASH2PQ6VEQ5 465 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 TAOK1Q7L7X3 1001 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 TMC6Q7Z403 805 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 PDZD3Q86UT5 571 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 PHC2Q8IXK0 858 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 MICALL1Q8N3F8 863 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 RIN3Q8TB24 985 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 MAP6Q96JE9 813 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 EGFL8Q99944 293 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM8Q9BZR9 551 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 CD93Q9NPY3 652 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 PRDM10Q9NQV6 1147 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 PLSCR3Q9NRY6 295 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 NTNG1Q9Y2I2 539 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 DUSP10Q9Y6W6 482 aa-1.33□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 RP1P56715 2156 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ALPK3Q96L96 1907 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GU03 582 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 BLACEA4D250 179 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 FZD9O00144 591 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 MEN1O00255 615 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 CBFA2T3O75081 653 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 FZD7O75084 574 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ULK1O75385 1050 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 PRG2P13727 222 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 SSTR1P30872 391 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 SSTR4P31391 388 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 HYAL2Q12891 473 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 NBR1Q14596 966 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 KIF22Q14807 665 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 C4orf17Q53FE4 359 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 FBLN7Q53RD9 439 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 Q6ZS52 159 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 RAPH1Q70E73 1250 aa-1.34□□□□□ -2.62
SNORD54-201ENST00000459159 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa-1.34□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms