RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIF22Q14807 665 aa18.79■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.79■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TATDN1Q6P1N9 297 aa18.79■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR18Q9BV38 432 aa18.79■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GINM1Q9NU53 330 aa18.79■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.79■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRKAB2O43741 272 aa18.78■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCRP11274 1271 aa18.78■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RGS19P49795 217 aa18.78■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EVX2Q03828 476 aa18.78■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MTMR2Q13614 643 aa18.78■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SH3D19Q5HYK7 790 aa18.78■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.78■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.77■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GH2P01242 217 aa18.77■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTGFP29279 349 aa18.77■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SHMT1P34896 483 aa18.77■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERC2O15083 957 aa18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP2D6P10635 497 aa18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BACE1P56817 501 aa18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GABPAQ06546 454 aa18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AAMPQ13685 434 aa18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.76■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MX1P20591 662 aa18.75■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSMC4P43686 418 aa18.75■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GCC1Q96CN9 775 aa18.75■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM47Q96LD4 638 aa18.75■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PNMA3Q9UL41 463 aa18.75■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP17L10C9JJH3 530 aa18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GNRH1P01148 92 aa18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABCB5Q2M3G0 1257 aa18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.74■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C19orf81C9J6K1 198 aa18.73■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OSBPP22059 807 aa18.73■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18.73■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APPBP2Q92624 585 aa18.73■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OSBP2Q969R2 916 aa18.73■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARMC5Q96C12 935 aa18.73■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CENPFP49454 3210 aa18.72■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa18.72■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa18.72■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.72■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.72■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CABP5Q9NP86 173 aa18.72■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MGAMO43451 1857 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP17L12C9JPN9 530 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP17L21D6R901 530 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMIM22K7EJ46 135 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GUCY1A2P33402 732 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRMT2P55345 433 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FCGRTP55899 365 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C12orf60Q5U649 245 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP17L2Q6R6M4 530 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AMOTL1Q8IY63 956 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FEZ1Q99689 392 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EMILIN3Q9NT22 766 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SRRDQ9UH36 339 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SWAP70Q9UH65 585 aa18.71■□□□□ 0.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HOXD10P28358 340 aa18.7■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEPT2Q15019 361 aa18.7■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM110CQ1W6H9 321 aa18.7■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACER1Q8TDN7 264 aa18.7■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FSD1Q9BTV5 496 aa18.7■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYPNQ86TC9 1320 aa18.7■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 M0R2C6 588 aa18.69■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPAA1O43292 621 aa18.69■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRKCZQ05513 592 aa18.69■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTR9Q6PD62 1173 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms