RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 HAND2P61296 217 aa13.16□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 SBK1Q52WX2 424 aa13.16□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 JMYQ8N9B5 988 aa13.16□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.16□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 PTPN18Q99952 460 aa13.16□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.16□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 NBPF3Q9H094 633 aa13.16□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 NAPBQ9H115 298 aa13.16□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 TSKSQ9UJT2 592 aa13.16□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 ZHX2Q9Y6X8 837 aa13.16□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 PPARAQ07869 468 aa13.15□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 NOGQ13253 232 aa13.15□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 GIMAP6Q6P9H5 292 aa13.15□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 C16orf86Q6ZW13 317 aa13.15□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 ERO1BQ86YB8 467 aa13.15□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 DDRGK1Q96HY6 314 aa13.15□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 PICK1Q9NRD5 415 aa13.15□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa13.15□□□□□ -0.3
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RPRD1B-202ENST00000449186 HIP1O00291 1037 aa13.14□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 SGSM2O43147 1006 aa13.14□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 MOGSQ13724 837 aa13.14□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 SEPT2Q15019 361 aa13.14□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 NACAP1Q9BZK3 213 aa13.14□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.14□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa13.14□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 PTPRFP10586 1907 aa13.13□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 RASA1P20936 1047 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 MAP2K2P36507 400 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 PPATQ06203 517 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 SPP2Q13103 211 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 PPIL2Q13356 520 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 RAB3GAP1Q15042 981 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 ALX1Q15699 326 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCB5Q2M3G0 1257 aa13.13□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 TICAM2Q86XR7 235 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 TBC1D10CQ8IV04 446 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 ACER1Q8TDN7 264 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 CCL15Q16663 113 aa13.12□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 AMOTL1Q8IY63 956 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM43AQ8N2R8 423 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 WBP1LQ9NX94 342 aa13.12□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 RNF186Q9NXI6 227 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 SWAP70Q9UH65 585 aa13.11□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 LAMA4Q16363 1823 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 RAD50Q92878 1312 aa13.11□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 BTBD19C9JJ37 291 aa13.1□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 TBC1D8O95759 1140 aa13.1□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 GPAT2Q6NUI2 795 aa13.1□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF280CQ8ND82 737 aa13.1□□□□□ -0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 GTF2A2P52657 109 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 SNAPC2Q13487 334 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 GADL1Q6ZQY3 521 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 CHMP4CQ96CF2 233 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 EMILIN3Q9NT22 766 aa13.09□□□□□ -0.31
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