RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 GPR25O00155 361 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 SPP2Q13103 211 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 CRHR2Q13324 411 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 MOGSQ13724 837 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 CTR9Q6PD62 1173 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 GH2P01242 217 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 APPP05067 770 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 TICAM2Q86XR7 235 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 SWAP70Q9UH65 585 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 SMIM22K7EJ46 135 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 TDO2P48775 406 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 FAM227BQ96M60 508 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 PDHXO00330 501 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 NEFLP07196 543 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 SBK1Q52WX2 424 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 TNS4Q8IZW8 715 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 WDR18Q9BV38 432 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 CABP5Q9NP86 173 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 A0A0D9SFI3 127 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 SDSP20132 328 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 TTC22Q5TAA0 569 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 FKTNO75072 461 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 CDK8P49336 464 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 MTMR2Q13614 643 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.56■■□□□ 1.04
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HERC3-205ENST00000426683 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 HMGCS2P54868 508 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 NAPBQ9H115 298 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 BACE1P56817 501 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 DGKZQ13574 1117 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 VPS53Q5VIR6 699 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 USP17L10C9JJH3 530 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 FOXP2O15409 715 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 TLR2O60603 784 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 AKR1B1P15121 316 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 GUCY1A2P33402 732 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 SEPT2Q15019 361 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 TREML2Q5T2D2 321 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.53■■□□□ 1.04
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HERC3-205ENST00000426683 C19orf81C9J6K1 198 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 HIP1O00291 1037 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 CYP2C8P10632 490 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 CCDC17Q96LX7 622 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-205ENST00000426683 SP3Q02447 781 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 ACER1Q8TDN7 264 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 FEZ1Q99689 392 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 CPA4Q9UI42 421 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 PPARAQ07869 468 aa21.5■■□□□ 1.03
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