RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393362.8

MAPK9-204, Transcript of mitogen-activated protein kinase 9, human

TSL 5

Gene MAPK9, Length 1,344 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAPK9-204	ENST00000393362	MBD4	O95243	580 aa		40.37	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	40.37	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		40.37	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	GINM1	Q9NU53	330 aa		40.37	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		40.37	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	KIF22	Q14807	665 aa		40.36	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		40.35	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	GABPA	Q06546	454 aa		40.35	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	GPATCH3	Q96I76	525 aa		40.35	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	GH2	P01242	217 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	CYP2D6	P10635	497 aa		40.33	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	SHMT1	P34896	483 aa		40.33	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	PSMC4	P43686	418 aa		40.33	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	BACE1	P56817	501 aa		40.33	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	TRIM47	Q96LD4	638 aa		40.33	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	MTMR2	Q13614	643 aa		40.32	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		40.32	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	40.31	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		40.31	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	40.31	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	40.3	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		40.3	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		40.3	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		40.29	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	USP17L10	C9JJH3	530 aa		40.28	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	GNRH1	P01148	92 aa		40.28	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		40.28	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	ARMC5	Q96C12	935 aa		40.28	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	C19orf81	C9J6K1	198 aa		40.27	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	SMIM22	K7EJ46	135 aa		40.27	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MAPK9-204	ENST00000393362	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		40.26	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	OSBP	P22059	807 aa		40.25	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	GUCY1A2	P33402	732 aa		40.25	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	OSBP2	Q969R2	916 aa		40.25	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		40.25	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	PNMA3	Q9UL41	463 aa		40.25	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		40.25	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	MYH7	P12883	1935 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	GCC1	Q96CN9	775 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	40.24	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	SRRD	Q9UH36	339 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		40.23	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	AAMP	Q13685	434 aa		40.23	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		40.23	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	CENPF	P49454	3210 aa		40.23	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	ERC2	O15083	957 aa		40.22	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	MX1	P20591	662 aa		40.22	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	40.22	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		40.22	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	USP17L12	C9JPN9	530 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	USP17L21	D6R901	530 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	PRMT2	P55345	433 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	C12orf60	Q5U649	245 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	ACER1	Q8TDN7	264 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	APPBP2	Q92624	585 aa		40.2	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	CABP5	Q9NP86	173 aa		40.2	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	40.2	■■■■■ 4.03
MAPK9-204	ENST00000393362	HOXD10	P28358	340 aa		40.19	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	FCGRT	P55899	365 aa		40.19	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		40.19	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	ZNF333	Q96JL9	665 aa		40.19	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	40.19	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	SEPT2	Q15019	361 aa		40.18	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		40.18	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		40.18	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	POTEF	A5A3E0	1075 aa		40.17	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	CTR9	Q6PD62	1173 aa		40.17	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	GABRQ	Q9UN88	632 aa		40.17	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	40.17	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	40.16	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	SWAP70	Q9UH65	585 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	PRKCZ	Q05513	592 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	NBPF11	Q86T75	865 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	40.16	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	MYPN	Q86TC9	1320 aa		40.15	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	IGHD	P01880	384 aa		40.15	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	C12orf42	Q96LP6	360 aa		40.15	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362	STAP2	Q9UGK3	403 aa		40.15	■■■■■ 4.02
MAPK9-204	ENST00000393362		M0R2C6	588 aa		40.14	■■■■■ 4.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 207.9 ms