RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.96■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L5A8MUK1 530 aa17.95■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 FKTNO75072 461 aa17.95■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 PDE4AP27815 886 aa17.95■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 DGKZQ13574 1117 aa17.95■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa17.95■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 EVI5LQ96CN4 794 aa17.95■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 DYNLL2Q96FJ2 89 aa17.95■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 GSG1L2A8MUP6 293 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L12C9JPN9 530 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L21D6R901 530 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 PDHXO00330 501 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 GH2P01242 217 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 ASNSP08243 561 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 SPP2Q13103 211 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 GADL1Q6ZQY3 521 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF280CQ8ND82 737 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 OSBPL3Q9H4L5 887 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 CAP1Q01518 475 aa17.93■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf60Q5U649 245 aa17.93■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 CTR9Q6PD62 1173 aa17.93■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa17.93■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 LOC285556D6RIA3 1793 aa17.93■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRA2Q96PE1 1338 aa17.93■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 HMGCS2P54868 508 aa17.92■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 TREML2Q5T2D2 321 aa17.92■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 WDR18Q9BV38 432 aa17.92■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D2Q9BYX2 928 aa17.92■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 AS3MTQ9HBK9 375 aa17.92■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 GINM1Q9NU53 330 aa17.92■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 TLR2O60603 784 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 CYP2C8P10632 490 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 GUCY1A2P33402 732 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 MTMR2Q13614 643 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 ABCB5Q2M3G0 1257 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 CD99L2Q8TCZ2 262 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0D9SFI3 127 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 SP3Q02447 781 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 SH3D19Q5HYK7 790 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 IFFO2Q5TF58 517 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 C16orf86Q6ZW13 317 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 RILPL2Q969X0 211 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 FAM227BQ96M60 508 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 SWAP70Q9UH65 585 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG1-201ENST00000361211 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 FOXP2O15409 715 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 GNAT2P19087 354 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CDK8P49336 464 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 BACE1P56817 501 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SEPT2Q15019 361 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 RAB3GAP1Q15042 981 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SBK1Q52WX2 424 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 GIMAP6Q6P9H5 292 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 C17orf99Q6UX52 265 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 AMOTL1Q8IY63 956 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ABHD8Q96I13 439 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CPA4Q9UI42 421 aa17.89■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L10C9JJH3 530 aa17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 APPP05067 770 aa17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 AKR1B1P15121 316 aa17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TDO2P48775 406 aa17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 IFNL3Q8IZI9 196 aa17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 STK11IPQ8N1F8 1099 aa17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ACER1Q8TDN7 264 aa17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CABP5Q9NP86 173 aa17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MYH8P13535 1937 aa17.88■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MINDY4BA8MYZ0 360 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CAPN15O75808 1086 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 VPS53Q5VIR6 699 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC10AQ8IUN9 316 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ERO1AQ96HE7 468 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ROBO3Q96MS0 1386 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 HELLSQ9NRZ9 838 aa17.86■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.86■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM17Q9Y577 477 aa17.86■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 C19orf81C9J6K1 198 aa17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms