RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 TLR2O60603 784 aa30.63■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 AMOTL1Q8IY63 956 aa30.63■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 APPBP2Q92624 585 aa30.63■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 SALL3Q9BXA9 1300 aa30.63■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC85CA6NKD9 419 aa30.62■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 GPAT2Q6NUI2 795 aa30.62■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 GINM1Q9NU53 330 aa30.62■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa30.62■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 MYH8P13535 1937 aa30.62■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 CYP2D6P10635 497 aa30.61■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 PDE1AP54750 535 aa30.61■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 JAG1P78504 1218 aa30.61■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 TATDN1Q6P1N9 297 aa30.61■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 TRIM17Q9Y577 477 aa30.61■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 GH2P01242 217 aa30.6■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 HMGCS2P54868 508 aa30.6■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 OSBP2Q969R2 916 aa30.6■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 STAP2Q9UGK3 403 aa30.6■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 CHD1LQ86WJ1 897 aa30.59■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 CPA4Q9UI42 421 aa30.59■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 CYP2C8P10632 490 aa30.58■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 ABCB5Q2M3G0 1257 aa30.58■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
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CTXN1-201ENST00000318978 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa30.58■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 LOC285556D6RIA3 1793 aa30.58■■■□□ 2.49
CTXN1-201ENST00000318978 SHMT1P34896 483 aa30.57■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 NUCB1Q02818 461 aa30.57■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 EVX2Q03828 476 aa30.57■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 MTMR2Q13614 643 aa30.57■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 KIF22Q14807 665 aa30.57■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 RAB3GAP1Q15042 981 aa30.57■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGEF6Q15052 776 aa30.57■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 EFCC1Q9HA90 598 aa30.57■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 TMOD4Q9NZQ9 345 aa30.57■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa30.57■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 USP17L12C9JPN9 530 aa30.56■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 USP17L21D6R901 530 aa30.56■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 GABPAQ06546 454 aa30.56■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 OTOP1Q7RTM1 612 aa30.56■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa30.55■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 USP17L10C9JJH3 530 aa30.55■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 M0R2C6 588 aa30.55■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 GPAA1O43292 621 aa30.55■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
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CTXN1-201ENST00000318978 TREML2Q5T2D2 321 aa30.55■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
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CTXN1-201ENST00000318978 DYNLL2Q96FJ2 89 aa30.55■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 SWAP70Q9UH65 585 aa30.55■■■□□ 2.48
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CTXN1-201ENST00000318978 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP30.54■■■□□ 2.483e-9■■□□□ 12.1
CTXN1-201ENST00000318978 C17orf99Q6UX52 265 aa30.54■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 SLC44A5Q8NCS7 719 aa30.54■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 PNMA3Q9UL41 463 aa30.54■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 C19orf81C9J6K1 198 aa30.53■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 GNAT2P19087 354 aa30.53■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 SH3D19Q5HYK7 790 aa30.53■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 C12orf60Q5U649 245 aa30.53■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 FEZ1Q99689 392 aa30.53■■■□□ 2.48
CTXN1-201ENST00000318978 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
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CTXN1-201ENST00000318978 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa30.52■■■□□ 2.48
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CTXN1-201ENST00000318978 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
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CTXN1-201ENST00000318978 OSBPP22059 807 aa30.51■■■□□ 2.47
CTXN1-201ENST00000318978 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa30.51■■■□□ 2.47
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CTXN1-201ENST00000318978 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
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CTXN1-201ENST00000318978 CAP1Q01518 475 aa30.49■■■□□ 2.47
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CTXN1-201ENST00000318978 GIMAP6Q6P9H5 292 aa30.49■■■□□ 2.47
CTXN1-201ENST00000318978 USP17L2Q6R6M4 530 aa30.49■■■□□ 2.47
CTXN1-201ENST00000318978 RILPL2Q969X0 211 aa30.49■■■□□ 2.47
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CTXN1-201ENST00000318978 CDK8P49336 464 aa30.48■■■□□ 2.47
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CTXN1-201ENST00000318978 PTPN22Q9Y2R2 807 aa30.48■■■□□ 2.47
CTXN1-201ENST00000318978 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CTXN1-201ENST00000318978 SMIM22K7EJ46 135 aa30.47■■■□□ 2.47
CTXN1-201ENST00000318978 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CTXN1-201ENST00000318978 C16orf86Q6ZW13 317 aa30.47■■■□□ 2.47
CTXN1-201ENST00000318978 STK11IPQ8N1F8 1099 aa30.47■■■□□ 2.47
CTXN1-201ENST00000318978 NACAP1Q9BZK3 213 aa30.47■■■□□ 2.47
CTXN1-201ENST00000318978 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
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