RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 MAN1B1Q9UKM7 699 aa32.09■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 HOMER1Q86YM7 354 aa32.08■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 FANCBQ8NB91 859 aa32.08■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 SARSP49591 514 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 ZNF654Q8IZM8 581 aa32.07■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 SEC31BQ9NQW1 1179 aa32.07■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 BCAMP50895 628 aa32.07■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 PDE4BQ07343 736 aa32.07■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa32.07■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 SNAP23O00161 211 aa32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 CAMTA2O94983 1202 aa32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 PPARAQ07869 468 aa32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 SMARCE1Q969G3 411 aa32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 UBAC1Q9BSL1 405 aa32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 LRP2BPQ9P2M1 347 aa32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 V9GYY5 206 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 FOXN1O15353 648 aa32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 ZSCAN12O43309 604 aa32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 ANAPC4Q9UJX5 808 aa32.06■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP6O43182 974 aa32.05■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 MORC3Q14149 939 aa32.05■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 SPECC1Q5M775 1068 aa32.05■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa32.05■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP32.05■■■□□ 2.724e-7■□□□□ 10
UBP1-201ENST00000283628 MYH6P13533 1939 aa32.05■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa32.04■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 TMEM232C9JQI7 657 aa32.04■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 ZNF18P17022 549 aa32.04■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 INTS13Q9NVM9 706 aa32.04■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 SERTAD1Q9UHV2 236 aa32.04■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 ESR2Q92731 530 aa32.03■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa32.03■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 XBP1P17861 261 aa32.03■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 GRIN1Q05586 938 aa32.03■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 NR5A1Q13285 461 aa32.03■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 CCDC34Q96HJ3 373 aa32.03■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 TRIM65Q6PJ69 517 aa32.02■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 TMEM139Q8IV31 216 aa32.02■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 MIGA1Q8NAN2 632 aa32.02■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 SEC23AQ15436 765 aa32.01■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 REXO1L1PQ8IX06 675 aa32.01■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 SPATA20Q8TB22 786 aa32.01■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 NUP133Q8WUM0 1156 aa32.01■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa32.01■■■□□ 2.72
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa32.01■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 CYP7A1P22680 504 aa32.01■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 FAM53CQ9NYF3 392 aa32.01■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 DNAI1Q9UI46 699 aa32.01■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa32.01■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 PRR29P0C7W0 189 aa32■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 CHRNDQ07001 517 aa32■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 KRT222Q8N1A0 295 aa32■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 CCDC82Q8N4S0 544 aa32■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa31.99■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 TNKSO95271 1327 aa31.99■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 STX10O60499 249 aa31.99■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP31.99■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP31.99■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 NTSR2O95665 410 aa31.98■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 OXER1Q8TDS5 423 aa31.98■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 CABP5Q9NP86 173 aa31.98■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 ZNF804BA4D1E1 1349 aa31.98■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa31.98■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 KIF20AO95235 890 aa31.98■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 PLCD1P51178 756 aa31.98■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 CSRNP2Q9H175 543 aa31.98■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 TRIM75PA6NK02 468 aa31.97■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa31.97■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa31.97■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 BMP15O95972 392 aa31.96■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 DUOX1Q9NRD9 1551 aa31.96■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 USP21Q9UK80 565 aa31.96■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 PCP11498 1178 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 LINC00116Q8NCU8 138 aa31.96■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 MINDY4BA8MYZ0 360 aa31.95■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 PHF20Q9BVI0 1012 aa31.95■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
UBP1-201ENST00000283628 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 KRT2P35908 639 aa31.95■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 ADGRA1Q86SQ6 560 aa31.95■■■□□ 2.7
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