RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wnt7aP24383 349 aa18.21■□□□□ 0.51
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gjb4Q02738 266 aa18.21■□□□□ 0.51
Ptprn-201ENSMUST00000027404 1700013D24RikQ0P521 120 aa18.21■□□□□ 0.51
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam89aQ14BJ1 175 aa18.21■□□□□ 0.51
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc27a1Q60714 646 aa18.21■□□□□ 0.51
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vstm4T1NXB5 319 aa18.21■□□□□ 0.51
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4340L7N2C4 268 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smarcc1P97496 1104 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plbd2Q3TCN2 594 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cfap69Q8BH53 942 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Triml1Q8BVP1 470 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Terb1Q8C0V1 768 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf131Q8K3J5 619 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Foxo4Q9WVH3 505 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Foxp1P58462 705 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam83bQ0VBM2 1012 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PsdQ5DTT2 1024 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bsdc1Q80Y55 427 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slitrk3Q810B9 980 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mylk2Q8VCR8 613 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NsmfQ99NF2 532 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prr16A3KMN5 304 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ampd3O08739 766 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trap1aP19473 224 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp50Q6P8X6 390 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Efcab8Q8C9R9 203 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ZgpatQ8VDM1 511 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt82Q99M74 516 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Setdb1O88974 1307 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slit1Q80TR4 1531 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mdh1bQ5F204 500 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc38a10Q5I012 1090 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppm1eQ80TL0 749 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bicdl2Q8CHW5 507 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myo1cQ9WTI7 1063 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Enc1O35709 589 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LtbrP50284 415 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrriq3Q14DL3 633 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Madcam1Q61826 405 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hps6Q8BLY7 805 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phldb2Q8K1N2 1249 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt23Q99PS0 422 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Filip1Q9CS72 1211 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Capza3P70190 299 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpt2Q8BGT5 522 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FliiQ9JJ28 1271 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trip6Q9Z1Y4 480 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif3cO35066 796 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PparaP23204 468 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wasf1Q8R5H6 559 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NenfQ9CQ45 171 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ank1Q02357 1862 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp53P15975 1069 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ces3aQ63880 571 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfm5Q8BU90 496 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc39a11Q8BWY7 342 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ces3bQ8VCU1 571 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ParvgQ9ERD8 331 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Casp12O08736 419 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rad23aP54726 363 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MmeQ61391 750 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep85Q8BMK0 761 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd3dP04235 173 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mdh1P14152 334 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ell2Q3UKU1 639 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrd1Q8C0R9 853 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mis18aQ9CZJ6 204 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Siglec1Q62230 1695 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bnip3O55003 187 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SsbP32067 415 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cnnm2Q3TWN3 875 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RragbQ6NTA4 374 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Caps2Q8BUG5 550 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cfap45Q9D9U9 551 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myh1Q5SX40 1942 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sycp1Q62209 993 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AmfrQ9R049 643 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bcl9Q9D219 1425 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rfc1P35601 1131 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nek1P51954 1203 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ric1Q69ZJ7 1422 aa18.15■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hgh1Q8C3I8 393 aa18.15■□□□□ 0.5
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pde5aQ8CG03 865 aa18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.6 ms