Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTI7

Myo1c, Unconventional myosin-Ic, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1cQ9WTI7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Myo1cQ9WTI7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Myo1cQ9WTI7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Myo1cQ9WTI7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myo1cQ9WTI7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Myo1cQ9WTI7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Myo1cQ9WTI7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Myo1cQ9WTI7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Myo1cQ9WTI7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Myo1cQ9WTI7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Myo1cQ9WTI7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Myo1cQ9WTI7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Myo1cQ9WTI7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Myo1cQ9WTI7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Myo1cQ9WTI7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myo1cQ9WTI7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Myo1cQ9WTI7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo1cQ9WTI7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Myo1cQ9WTI7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Myo1cQ9WTI7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Myo1cQ9WTI7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Myo1cQ9WTI7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Myo1cQ9WTI7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Myo1cQ9WTI7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Myo1cQ9WTI7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Myo1cQ9WTI7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Myo1cQ9WTI7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Myo1cQ9WTI7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Myo1cQ9WTI7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Myo1cQ9WTI7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Myo1cQ9WTI7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Myo1cQ9WTI7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Myo1cQ9WTI7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Myo1cQ9WTI7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Myo1cQ9WTI7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Myo1cQ9WTI7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Myo1cQ9WTI7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Myo1cQ9WTI7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Myo1cQ9WTI7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Myo1cQ9WTI7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Myo1cQ9WTI7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Myo1cQ9WTI7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Myo1cQ9WTI7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Myo1cQ9WTI7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Myo1cQ9WTI7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Myo1cQ9WTI7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myo1cQ9WTI7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Myo1cQ9WTI7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Myo1cQ9WTI7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Myo1cQ9WTI7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Myo1cQ9WTI7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Myo1cQ9WTI7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Myo1cQ9WTI7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo1cQ9WTI7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myo1cQ9WTI7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo1cQ9WTI7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Myo1cQ9WTI7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo1cQ9WTI7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo1cQ9WTI7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo1cQ9WTI7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo1cQ9WTI7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo1cQ9WTI7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo1cQ9WTI7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo1cQ9WTI7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo1cQ9WTI7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo1cQ9WTI7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo1cQ9WTI7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo1cQ9WTI7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo1cQ9WTI7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo1cQ9WTI7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo1cQ9WTI7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo1cQ9WTI7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo1cQ9WTI7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo1cQ9WTI7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo1cQ9WTI7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Myo1cQ9WTI7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo1cQ9WTI7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myo1cQ9WTI7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo1cQ9WTI7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo1cQ9WTI7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myo1cQ9WTI7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo1cQ9WTI7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myo1cQ9WTI7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myo1cQ9WTI7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo1cQ9WTI7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo1cQ9WTI7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo1cQ9WTI7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo1cQ9WTI7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo1cQ9WTI7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo1cQ9WTI7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1cQ9WTI7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1cQ9WTI7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1cQ9WTI7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1cQ9WTI7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo1cQ9WTI7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo1cQ9WTI7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo1cQ9WTI7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo1cQ9WTI7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo1cQ9WTI7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myo1cQ9WTI7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.4 ms