RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	SLURP2	P0DP57	97 aa		33	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		33	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	TRIM75P	A6NK02	468 aa		32.99	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM196B	A6NMK8	535 aa		32.99	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	HOXD10	P28358	340 aa		32.99	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		32.99	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		32.99	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	COG6	Q9Y2V7	657 aa		32.99	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		32.98	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		32.98	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF333	Q96JL9	665 aa		32.98	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	FLT1	P17948	1338 aa		32.98	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	SIPA1L1	O43166	1804 aa		32.98	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	CAP2	P40123	477 aa		32.97	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	PSMC4	P43686	418 aa		32.97	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	CYP2C8	P10632	490 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	CYP7A1	P22680	504 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	MAP3K12	Q12852	859 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	MGAM	O43451	1857 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		32.95	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		32.95	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		32.95	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
LYNX1-208	ENST00000615007	POTEF	A5A3E0	1075 aa		32.94	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	BCR	P11274	1271 aa		32.94	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		32.94	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	SRRD	Q9UH36	339 aa		32.94	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	PNMA3	Q9UL41	463 aa		32.94	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L5	A8MUK1	530 aa		32.93	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	HLA-DOA	P06340	250 aa		32.93	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	TRIM47	Q96LD4	638 aa		32.93	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	MYH1	P12882	1939 aa		32.92	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	FCGRT	P55899	365 aa		32.92	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		32.92	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	RAB11FIP3	O75154	756 aa		32.91	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	SPP2	Q13103	211 aa		32.91	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	CENPF	P49454	3210 aa		32.9	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	ASNS	P08243	561 aa		32.9	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	OSBP	P22059	807 aa		32.9	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	32.9	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	RAET1E	Q8TD07	263 aa		32.9	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	GINM1	Q9NU53	330 aa		32.9	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	MYPN	Q86TC9	1320 aa		32.89	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	CTGF	P29279	349 aa		32.89	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		32.89	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		32.89	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	PALD1	Q9ULE6	856 aa		32.89	■■■□□ 2.86
LYNX1-208	ENST00000615007	APBB1	O00213	710 aa		32.88	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	USP5	P45974	858 aa		32.88	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	PDE3A	Q14432	1141 aa		32.88	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		32.88	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		32.88	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	32.88	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		32.88	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	HMGCS2	P54868	508 aa		32.86	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		32.86	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	DNAJC18	Q9H819	358 aa		32.86	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		32.85	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	TREML2	Q5T2D2	321 aa		32.85	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	WDR18	Q9BV38	432 aa		32.85	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	GRK4	P32298	578 aa		32.84	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		32.83	■■■□□ 2.85
LYNX1-208	ENST00000615007	PRKCZ	Q05513	592 aa		32.82	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		32.82	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	TTC6	Q86TZ1	520 aa		32.82	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		32.82	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	BACE1	P56817	501 aa		32.81	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	EHD4	Q9H223	541 aa		32.81	■■■□□ 2.84

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