RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNRH1P01148 92 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAP2P40123 477 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF22Q14807 665 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FLT1P17948 1338 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOX10P56693 466 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAP1Q01518 475 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM196BA6NMK8 535 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GINM1Q9NU53 330 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PALD1Q9ULE6 856 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DOCK1Q14185 1865 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM75PA6NK02 468 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HLA-DOAP06340 250 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP5JP18859 108 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPA4Q9UI42 421 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L5A8MUK1 530 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP5P45974 858 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRMT2P55345 433 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARMC5Q96C12 935 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOCADQ5VW36 1801 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLIM4O00461 696 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASNSP08243 561 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP2C8P10632 490 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPP2Q13103 211 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR18Q9BV38 432 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCTPP1Q9H773 170 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCRP11274 1271 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE6AP16499 860 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF11Q86T75 865 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC6Q86TZ1 520 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJC18Q9H819 358 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HTTP42858 3142 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXD10P28358 340 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMC4P43686 418 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HAUS7Q99871 368 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCL11AQ9H165 835 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EHD4Q9H223 541 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PNMA3Q9UL41 463 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRFP10586 1907 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTGFP29279 349 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM47Q96LD4 638 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIPA1L1O43166 1804 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C19orf81C9J6K1 198 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HMGCS2P54868 508 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BACE1P56817 501 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 JAG1P78504 1218 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TREML2Q5T2D2 321 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF333Q96JL9 665 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRRDQ9UH36 339 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADD2P35612 726 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FCGRTP55899 365 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms