RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCAR3	O75815	825 aa		7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEFM	P07197	916 aa		7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNAI1	P63096	354 aa		7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266		A6NHS1	94 aa		7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BM21	787 aa		7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDB1	Q16531	1140 aa		7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	SV2A	Q7L0J3	742 aa		7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLIN1	O60240	522 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSX2	Q9BZM3	304 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	EFCC1	Q9HA90	598 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHF24	Q9UPV7	400 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCL9	O00512	1426 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTBD11	A6QL63	1104 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	XYLB	O75191	536 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGFR3	P22607	806 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	CABP4	P57796	275 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF790	Q6PG37	636 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	RGS12	O14924	1447 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC14C	A4D256	554 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEF	Q10587	303 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCIN	Q13939	588 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	PROSER3	Q2NL68	480 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	G2E3	Q7L622	706 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP16	Q9Y5T5	823 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR25	O00155	361 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF21	O75509	655 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	RLBP1	P12271	317 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD33	P20138	364 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLCB3	Q01970	1234 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAS6	Q14393	721 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC30A3	Q99726	388 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELP3	Q9H9T3	547 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANXA1	P04083	346 aa		7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	VEGFB	P49765	207 aa		7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTBS	Q01459	385 aa		7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFAT	Q9P243	1243 aa		7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		7.88	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2CD2L	O14523	706 aa		7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	RXRB	P28702	533 aa		7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15

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