RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 NT5C2P49902 561 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 PICALMQ13492 652 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 PKP1Q13835 747 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 SGMS1Q86VZ5 419 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 PLCD1P51178 756 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 CCT2P78371 535 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 NFKBIBQ15653 356 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 TMTC2Q8N394 836 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 FOCADQ5VW36 1801 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 WTAPQ15007 396 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 IQCA1Q86XH1 822 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF287Q9HBT7 754 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 DYNLL2Q96FJ2 89 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 GMLQ99445 158 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 HDAC9Q9UKV0 1011 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC69A6NI79 296 aa31.45■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 CXCL9Q07325 125 aa31.45■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 OGFOD1Q8N543 542 aa31.45■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 MKNK2Q9HBH9 465 aa31.45■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 APOA5Q6Q788 366 aa31.45■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 SENP2Q9HC62 589 aa31.45■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa31.45■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 MYH1P12882 1939 aa31.44■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP100Q494V2 611 aa31.44■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 CIAPIN1Q6FI81 312 aa31.44■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 AGBL3Q8NEM8 1001 aa31.44■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 HPS5Q9UPZ3 1129 aa31.44■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 TTC6Q86TZ1 520 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 SLC12A7Q9Y666 1083 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 TNKSO95271 1327 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 DTNBO60941 627 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 RASSF7Q02833 373 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 NBR1Q14596 966 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 ZDHHC9Q9Y397 364 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 TSPY2A6NKD2 308 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB43O43298 467 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 BRD1O95696 1058 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 PDCP20941 246 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 TNIP1Q15025 636 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 JAK2O60674 1132 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 SYT1P21579 422 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 FAM47AQ5JRC9 791 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 C16orf86Q6ZW13 317 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 ECM29Q5VYK3 1845 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 SEC23AQ15436 765 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 GBP4Q96PP9 640 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 STX6O43752 255 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 NFIAQ12857 509 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 IDI2Q9BXS1 227 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 CPLX1O14810 134 aa31.39■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 CTDNEP1O95476 244 aa31.39■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 CDK8P49336 464 aa31.39■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 MICU3Q86XE3 530 aa31.39■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 SLC44A5Q8NCS7 719 aa31.39■■■□□ 2.62
HOXB3-210ENST00000489475 PTPDC1A2A3K4 754 aa31.38■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 TFAP4Q01664 338 aa31.38■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 KIF3AQ9Y496 699 aa31.38■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 NPM3O75607 178 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 DLGAP5Q15398 846 aa31.38■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 HLA-DOAP06340 250 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 CACNB3P54284 484 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 FAM184AQ8NB25 1140 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 DDX11Q96FC9 970 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 SPDYE2BA6NHP3 402 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA8AA7E2F4 631 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 SPDYE6P0CI01 402 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 TSPY3P0CV98 308 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 TSPY8P0CW00 308 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 RXRAP19793 462 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 RASA1P20936 1047 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 RCAN1P53805 252 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 MYL10Q9BUA6 226 aa31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms