RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF7Q2M1P5 1343 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 RIC1Q4ADV7 1423 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 SCN9AQ15858 1988 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.48□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 ADH1CP00326 375 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 INHAP05111 366 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS12P25398 132 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 BMP8BP34820 402 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 INHBEP58166 350 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP4P98171 946 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP3K12Q12852 859 aa5.48□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 EHBP1Q8NDI1 1231 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 GAS2L2Q8NHY3 880 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.48□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 LAMB2P55268 1798 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 MUC3AQ02505 3323 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 UNCXA6NJT0 531 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM177BA6PVY3 158 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 E9PSI1 815 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 WNT7AO00755 349 aa5.47□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 EGFRP00533 1210 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 FSHRP23945 695 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 GDF10P55107 478 aa5.47□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 FOXK2Q01167 660 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 SP3Q02447 781 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.47□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 CAPN12Q6ZSI9 719 aa5.47□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.47□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 HINFPQ9BQA5 517 aa5.47□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.47□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 SEPT3Q9UH03 358 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.47□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 H3BRB1 525 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMD14O00487 310 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 BACH1O14867 736 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 GNRH1P01148 92 aa5.46□□□□□ -1.54
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ECHDC1-211ENST00000460558 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB15P59190 212 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 MTFR1Q15390 333 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 SPRYD7Q5W111 196 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 HELQQ8TDG4 1101 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 NYXQ9GZU5 481 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.46□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCC12Q96J65 1359 aa5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 HEG1Q9ULI3 1381 aa5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 YDJCA8MPS7 323 aa5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 RNMTO43148 476 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 A1BGP04217 495 aa5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 NR3C2P08235 984 aa5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 CRHR2Q13324 411 aa5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 COL19A1Q14993 1142 aa5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP2U1Q7Z449 544 aa5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 TDHQ8IZJ6 230 aa5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.45□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 GUCD1Q96NT3 240 aa5.45□□□□□ -1.54
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