RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, human

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ODC1-204	ENST00000446285	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
ODC1-204	ENST00000446285	MAP3K12	Q12852	859 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ODC1-204	ENST00000446285	CYP7A1	P22680	504 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ODC1-204	ENST00000446285	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ODC1-204	ENST00000446285	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ODC1-204	ENST00000446285	FLT1	P17948	1338 aa		32.51	■■■□□ 2.8
ODC1-204	ENST00000446285	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		32.51	■■■□□ 2.8
ODC1-204	ENST00000446285	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		32.51	■■■□□ 2.8
ODC1-204	ENST00000446285	SLURP2	P0DP57	97 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	32.51	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	ARMC5	Q96C12	935 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	PRMT2	P55345	433 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	CAP1	Q01518	475 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		32.49	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		32.49	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	FAM196B	A6NMK8	535 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	CAP2	P40123	477 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	CPA4	Q9UI42	421 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	SIPA1L1	O43166	1804 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	TRIM75P	A6NK02	468 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	APBB1	O00213	710 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	HLA-DOA	P06340	250 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	GINM1	Q9NU53	330 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	NBPF11	Q86T75	865 aa		32.45	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		32.45	■■■□□ 2.79
ODC1-204	ENST00000446285	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	MYH1	P12882	1939 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	CENPF	P49454	3210 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	USP17L5	A8MUK1	530 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	HOXD10	P28358	340 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	ASNS	P08243	561 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	CYP2C8	P10632	490 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	BCR	P11274	1271 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	USP5	P45974	858 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	PNMA3	Q9UL41	463 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	PALD1	Q9ULE6	856 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	PSMC4	P43686	418 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	SPP2	Q13103	211 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	ZNF333	Q96JL9	665 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	32.39	■■■□□ 2.78	4e-19	■□□□□ 9.5
ODC1-204	ENST00000446285	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	WDR18	Q9BV38	432 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	DNAJC18	Q9H819	358 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ODC1-204	ENST00000446285	MGAM	O43451	1857 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	TRIM47	Q96LD4	638 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	SRRD	Q9UH36	339 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	PDE6A	P16499	860 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	FCGRT	P55899	365 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	EHD4	Q9H223	541 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	GOLIM4	O00461	696 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	ATP5J	P18859	108 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	TTC6	Q86TZ1	520 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	CTGF	P29279	349 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	OSBP	P22059	807 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	HMGCS2	P54868	508 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	TREML2	Q5T2D2	321 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	MYPN	Q86TC9	1320 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ODC1-204	ENST00000446285	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		32.32	■■■□□ 2.76

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