RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 CERS3Q8IU89 383 aa28.7■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 USP40Q9NVE5 1235 aa28.7■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 FZD9O00144 591 aa28.69■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 FLT1P17948 1338 aa28.69■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 CFAP100Q494V2 611 aa28.68■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 AKNAD1Q5T1N1 836 aa28.68■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 CCDC39Q9UFE4 941 aa28.68■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.68■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.67■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 SHTN1A0MZ66 631 aa28.67■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 LMNB1P20700 586 aa28.67■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 AGBL3Q8NEM8 1001 aa28.67■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 B4E1Z4 1266 aa28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 PICALMQ13492 652 aa28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 NCOA7Q8NI08 942 aa28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 LMBRD1Q9NUN5 540 aa28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 CACNB3P54284 484 aa28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 ANTXR2P58335 489 aa28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 SBK1Q52WX2 424 aa28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 NFIAQ12857 509 aa28.65■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 TNIP1Q15025 636 aa28.65■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 RBSNQ9H1K0 784 aa28.65■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.65■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 Q6ZUG5 572 aa28.65■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 CYB5R4Q7L1T6 521 aa28.65■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 TMX3Q96JJ7 454 aa28.65■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 C12orf60Q5U649 245 aa28.64■■■□□ 2.18
CTU1-201ENST00000421832 PLCD1P51178 756 aa28.63■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.63■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 LARGE1O95461 756 aa28.63■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 MCM2P49736 904 aa28.63■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 TRDNQ13061 729 aa28.63■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 OGFOD1Q8N543 542 aa28.63■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.63■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 PRDM1O75626 825 aa28.62■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.62■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 DYNLL2Q96FJ2 89 aa28.62■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 TOMM22Q9NS69 142 aa28.62■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.61■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 PRC1O43663 620 aa28.61■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 KDM4AO75164 1064 aa28.61■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 SPDYE6P0CI01 402 aa28.61■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.61■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.61■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.6■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 ZSWIM5Q9P217 1185 aa28.6■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 FGRP09769 529 aa28.59■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 DLGAP5Q15398 846 aa28.59■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 MCTP1Q6DN14 999 aa28.59■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 BRF1Q92994 677 aa28.59■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.59■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 CNNM2Q9H8M5 875 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 RNF181Q9P0P0 153 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 EGFRP00533 1210 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 TCP10Q12799 353 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 KRT23Q9C075 422 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CTU1-201ENST00000421832 ROBO3Q96MS0 1386 aa28.57■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 ME3Q16798 604 aa28.57■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 LRSAM1Q6UWE0 723 aa28.57■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 CLRN2A0PK11 232 aa28.57■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 FGD1P98174 961 aa28.57■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 GPR162Q16538 588 aa28.57■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 IDI2Q9BXS1 227 aa28.57■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 DMTNQ08495 405 aa28.56■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.56■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 APOBRQ0VD83 1088 aa28.55■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD1Q15327 319 aa28.55■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.55■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.55■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.55■■■□□ 2.16
CTU1-201ENST00000421832 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms