RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCT2Q8NC54 265 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASIC4Q96FT7 647 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 PICK1Q9NRD5 415 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 PAPLNO95428 1278 aa5.14□□□□□ -1.59
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RNU6-601P-201ENST00000384540 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRIG2O94898 1065 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 INPP5AQ14642 412 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 AOC3Q16853 763 aa5.13□□□□□ -1.59
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RNU6-601P-201ENST00000384540 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 ITIH2P19823 946 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 CAP2P40123 477 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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RNU6-601P-201ENST00000384540 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 AK5Q9Y6K8 562 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.11□□□□□ -1.59
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RNU6-601P-201ENST00000384540 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD96P40200 585 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLCN7P51798 805 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 OGFOD2Q6N063 350 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 HDXQ7Z353 690 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
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RNU6-601P-201ENST00000384540 FBRSQ9HAH7 460 aa5.11□□□□□ -1.59
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RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASB11Q8WXH4 323 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 FOXQ1Q9C009 403 aa5.1□□□□□ -1.59
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RNU6-601P-201ENST00000384540 BTBD11A6QL63 1104 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLITRK5O94991 958 aa5.09□□□□□ -1.59
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RNU6-601P-201ENST00000384540 LIG3P49916 1009 aa5.09□□□□□ -1.59
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RNU6-601P-201ENST00000384540 NKG7Q16617 165 aa5.08□□□□□ -1.6
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RNU6-601P-201ENST00000384540 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 MIPEPQ99797 713 aa5.08□□□□□ -1.6
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RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 GFRA2O00451 464 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 LMNB1P20700 586 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 GRK4P32298 578 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 DAB2P98082 770 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 IKZF1Q13422 519 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEPT6Q14141 434 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 MFSD4AQ8N468 514 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 PARP2Q9UGN5 583 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-601P-201ENST00000384540 RLBP1P12271 317 aa5.06□□□□□ -1.6
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