RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 C17orf99Q6UX52 265 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 FLT1P17948 1338 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 CAP2P40123 477 aa24.7■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 PRMT2P55345 433 aa24.68■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.68■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 HLA-DOAP06340 250 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 ATP5JP18859 108 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 DOCK2Q92608 1830 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 USP17L5A8MUK1 530 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 APBB1O00213 710 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 ASNSP08243 561 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 SLURP2P0DP57 97 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 ARMC5Q96C12 935 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 EHD4Q9H223 541 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 DCTPP1Q9H773 170 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 PALD1Q9ULE6 856 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX3-201ENST00000370002 TTC6Q86TZ1 520 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 WDR18Q9BV38 432 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 AK9Q5TCS8 1911 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 TRIM75PA6NK02 468 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 FAM196BA6NMK8 535 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 HOXD10P28358 340 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 USP5P45974 858 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 NBPF11Q86T75 865 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 GOLIM4O00461 696 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 BCRP11274 1271 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 PDE6AP16499 860 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 SOX10P56693 466 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 CAP1Q01518 475 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 HAUS7Q99871 368 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 PNMA3Q9UL41 463 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 SPP2Q13103 211 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 DNAJC18Q9H819 358 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 CPA4Q9UI42 421 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 C19orf81C9J6K1 198 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 CYP2C8P10632 490 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 PSMC4P43686 418 aa24.58■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 BACE1P56817 501 aa24.58■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 HTTP42858 3142 aa24.58■■□□□ 1.53
PITX3-201ENST00000370002 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 SRRDQ9UH36 339 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 DOCK1Q14185 1865 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 ADD2P35612 726 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 UBE3CQ15386 1083 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 GPATCH3Q96I76 525 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 ZNF333Q96JL9 665 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 USP17L10C9JJH3 530 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 FCGRTP55899 365 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 TRIM47Q96LD4 638 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 OSBPP22059 807 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 HMGCS2P54868 508 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 AAMPQ13685 434 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms