RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.73■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 GRM8O00222 908 aa20.73■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 SLURP2P0DP57 97 aa20.73■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.73■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.72■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 KIF16BQ96L93 1317 aa20.72■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 F6X3S4 739 aa20.71■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 RGS3P49796 1198 aa20.71■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 USP40Q9NVE5 1235 aa20.71■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC24Q50LG9 513 aa20.7■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.7■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.7■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 KAZALD1Q96I82 304 aa20.7■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 IDI2Q9BXS1 227 aa20.7■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 ENTPD3O75355 529 aa20.69■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 PDE8BO95263 885 aa20.69■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 PRDX5P30044 214 aa20.69■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 METTL24Q5JXM2 366 aa20.69■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.69■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K12Q12852 859 aa20.68■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 USP6NLQ92738 828 aa20.68■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 SUCLG2Q96I99 432 aa20.67■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.67■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 FGFR2P21802 821 aa20.66■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 HMGCS2P54868 508 aa20.66■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 RTP1P59025 263 aa20.66■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.92e-11■■■■■ 114.2
SPCS1-201ENST00000233025 CCL14Q16627 93 aa20.66■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 PEX10O60683 326 aa20.65■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 SPP2Q13103 211 aa20.65■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.65■□□□□ 0.9
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.64■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.64■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.64■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.63■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 GRIN2CQ14957 1233 aa20.63■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.63■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 MORN1Q5T089 497 aa20.63■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 APBA2Q99767 749 aa20.63■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 SIPA1L1O43166 1804 aa20.62■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 GAKO14976 1311 aa20.62■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 RGS2P41220 211 aa20.62■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 PDE3AQ14432 1141 aa20.62■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 BADQ92934 168 aa20.62■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.61■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 DNM1LO00429 736 aa20.61■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 MAPK4P31152 587 aa20.61■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.61■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.61■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.61■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 REV3LO60673 3130 aa20.61■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 FAM196BA6NMK8 535 aa20.6■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D12O60347 775 aa20.6■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH1L1O75891 902 aa20.6■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 GPR142Q7Z601 462 aa20.6■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.6■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 LPAR1Q92633 364 aa20.6■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 PORCNQ9H237 461 aa20.6■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.59■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.59■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.59■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.59■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 UTYO14607 1347 aa20.58■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 VAMP4O75379 141 aa20.58■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 HERVK_113P62684 666 aa20.58■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 SNX17Q15036 470 aa20.58■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.58■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 ASB2Q96Q27 587 aa20.58■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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