RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zkscan4	Q5SZT6	480 aa		32.04	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nes	Q6P5H2	1864 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cep131	Q62036	1060 aa		32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Haus7	Q8BKT8	364 aa		32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kri1	Q8VDQ9	704 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Wdr78	E9PYY5	807 aa		32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zscan29	E9Q5B4	869 aa		32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam83b	Q0VBM2	1012 aa		32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Traf3ip1	Q149C2	625 aa		32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tmed8	Q3UHI4	326 aa		32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Smc2	Q8CG48	1191 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Inpp5b	Q8K337	993 aa		32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbm33	Q9CXK9	1231 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ktn1	Q61595	1327 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Evpl	Q9D952	2035 aa		32.02	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dnaaf4	Q8R368	420 aa		32.02	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mypop	Q8R4U1	393 aa		32.02	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	1700018B08Rik	Q9DA83	213 aa		32.02	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Col20a1	Q923P0	1320 aa		32.02	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp3a25	O09158	503 aa		32.01	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prpf3	Q922U1	683 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kcnh3	Q9WVJ0	1095 aa		32.01	■■■□□ 2.72
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cntnap1	O54991	1385 aa		32.01	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bin1	O08539	588 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cebpa	P53566	359 aa		32.01	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gas2l3	Q3UWW6	683 aa		32.01	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp7b1	Q60991	507 aa		32.01	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ttll4	Q80UG8	1193 aa		32.01	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rars	Q9D0I9	660 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ripk4	Q9ERK0	786 aa		32.01	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cnpy2	Q9QXT0	182 aa		32.01	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sema6b	O54951	886 aa		32	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tmtc2	Q56A06	836 aa		32	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbm26	Q6NZN0	1012 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pik3ap1	Q9EQ32	811 aa		32	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ubr3	Q5U430	1889 aa		32	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prss40	A6H6T1	365 aa		31.99	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Adck5	Q80V03	582 aa		31.99	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbm28	Q8CGC6	750 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Krt23	Q99PS0	422 aa		31.99	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Filip1	Q9CS72	1211 aa		31.99	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slfn1	Q9Z0I7	337 aa		31.99	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cdcp1	Q5U462	833 aa		31.99	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Etnk1	Q9D4V0	363 aa		31.99	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myo1b	P46735	1107 aa		31.98	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kif22	Q3V300	660 aa		31.98	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Large1	Q9Z1M7	756 aa		31.98	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mrpl12	Q9DB15	201 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prl2c1	Q5SVL9	228 aa		31.97	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Znf653	Q6YND2	615 aa		31.97	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cep120	Q7TSG1	988 aa		31.97	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc1a4	O35874	532 aa		31.96	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam89a	Q14BJ1	175 aa		31.96	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Znf638	Q61464	1960 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Atxn2l	Q7TQH0	1049 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrrc8a	Q80WG5	810 aa		31.96	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tob2	Q9JM55	345 aa		31.96	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ubac1	Q8VDI7	409 aa		31.96	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tfcp2	Q9ERA0	502 aa		31.96	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dctpp1	Q9QY93	170 aa		31.96	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ifi35	Q9D8C4	286 aa		31.95	■■■□□ 2.71
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Grin2d	Q03391	1323 aa		31.95	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Snapc4	Q8BP86	1333 aa		31.95	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cdkn1c	P49919	348 aa		31.95	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ehd2	Q8BH64	543 aa		31.95	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kiaa1524	Q8BWY9	907 aa		31.95	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tmem87a	Q8BXN9	555 aa		31.94	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rps6ka5	Q8C050	863 aa		31.94	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccz1	Q8C1Y8	480 aa		31.94	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm45140	A0A0N4SUM8	220 aa		31.93	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gas1	Q01721	343 aa		31.93	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kmt5b	Q3U8K7	883 aa		31.93	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ell2	Q3UKU1	639 aa		31.93	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Xpo4	Q9ESJ0	1151 aa		31.93	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hic2	Q9JLZ6	619 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Epb41l3	Q9WV92	929 aa		31.93	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Olfr119	Q7TRJ5	321 aa		31.93	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Clec16a	Q80U30	1036 aa		31.93	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tmem179	Q8BHH9	233 aa		31.93	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Atp8b5	A3FIN4	1183 aa		31.92	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fchsd1	Q6PFY1	688 aa		31.92	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Strip1	Q8C079	837 aa		31.92	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbm5	Q91YE7	815 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mbip	Q99LQ1	341 aa		31.92	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbm6	S4R1W5	1118 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ssb	P32067	415 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc7a1	Q09143	622 aa		31.91	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mum1l1	Q4VA55	681 aa		31.91	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vnn1	Q9Z0K8	512 aa		31.91	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Col11a2	Q64739	1736 aa		31.91	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp4x1	Q6A152	507 aa		31.91	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355		A0A1Y7VML8	143 aa		31.9	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Grin1	P35438	938 aa		31.9	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nmt2	O70311	529 aa		31.89	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc51	Q3URS9	406 aa		31.89	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mrps25	Q9D125	171 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppara	P23204	468 aa		31.88	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nfix	P70257	488 aa		31.88	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bend4	P86174	541 aa		31.88	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Grpel1	Q99LP6	217 aa		31.88	■■■□□ 2.69

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