RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-9	P26371	169 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPIN3-238	ENST00000640421	MDN1	Q9NU22	5596 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPIN3-238	ENST00000640421	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPIN3-238	ENST00000640421	PP632	Q6XCG6	107 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPIN3-238	ENST00000640421	MT1E	P04732	61 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SPIN3-238	ENST00000640421	MT1L	Q93083	61 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SPIN3-238	ENST00000640421	NEB	P20929	6669 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SPIN3-238	ENST00000640421	SPRR2E	P22531	72 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SPIN3-238	ENST00000640421	SPRR2B	P35325	72 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SPIN3-238	ENST00000640421	SPRR2A	P35326	72 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SPIN3-238	ENST00000640421	MT1G	P13640	62 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SPIN3-238	ENST00000640421	MT1M	Q8N339	61 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SPIN3-238	ENST00000640421	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SPIN3-238	ENST00000640421	SPRR2D	P22532	72 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SPIN3-238	ENST00000640421	NDUFAF8	A1L188	74 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SPIN3-238	ENST00000640421		H3BS24	57 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SPIN3-238	ENST00000640421	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SPIN3-238	ENST00000640421	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SPIN3-238	ENST00000640421	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
SPIN3-238	ENST00000640421	MT1A	P04731	61 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SPIN3-238	ENST00000640421	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.34	□□□□□ -1.56
SPIN3-238	ENST00000640421	MT4	P47944	62 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A0A0MQY5	61 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPIN3-238	ENST00000640421	INE1	O15225	51 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPIN3-238	ENST00000640421	MT3	P25713	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPIN3-238	ENST00000640421	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPIN3-238	ENST00000640421	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SPIN3-238	ENST00000640421	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.33	□□□□□ -1.72
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPIN3-238	ENST00000640421	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SPIN3-238	ENST00000640421	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPIN3-238	ENST00000640421	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SPIN3-238	ENST00000640421	PRM1	P04553	51 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SPIN3-238	ENST00000640421	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPIN3-238	ENST00000640421	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.33	□□□□□ -2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.01	□□□□□ -2.09

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