RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SPIN3-208	ENST00000638481	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SPIN3-208	ENST00000638481	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SPIN3-208	ENST00000638481	MT1L	Q93083	61 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPIN3-208	ENST00000638481	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPIN3-208	ENST00000638481	MT1G	P13640	62 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPIN3-208	ENST00000638481	MT1M	Q8N339	61 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPIN3-208	ENST00000638481	SPRR2E	P22531	72 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPIN3-208	ENST00000638481	SPRR2B	P35325	72 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPIN3-208	ENST00000638481	SPRR2A	P35326	72 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPIN3-208	ENST00000638481	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPIN3-208	ENST00000638481	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPIN3-208	ENST00000638481	SPRR2D	P22532	72 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SPIN3-208	ENST00000638481	NEB	P20929	6669 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPIN3-208	ENST00000638481	MT1A	P04731	61 aa		4.46	□□□□□ -1.7
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.45	□□□□□ -1.7
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SPIN3-208	ENST00000638481	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SPIN3-208	ENST00000638481	MT4	P47944	62 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPIN3-208	ENST00000638481	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SPIN3-208	ENST00000638481	MT3	P25713	68 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SPIN3-208	ENST00000638481	PRM1	P04553	51 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SPIN3-208	ENST00000638481	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SPIN3-208	ENST00000638481	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SPIN3-208	ENST00000638481	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.28	□□□□□ -1.89
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SPIN3-208	ENST00000638481	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SPIN3-208	ENST00000638481	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SPIN3-208	ENST00000638481	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.56	□□□□□ -2
SPIN3-208	ENST00000638481	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.49	□□□□□ -2.01
SPIN3-208	ENST00000638481	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.34	□□□□□ -2.04
SPIN3-208	ENST00000638481	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.57	□□□□□ -2.16

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