RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635555.1

LINC00466-210, long intergenic non-protein coding RNA 466, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00466, Length 1,016 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00466-210ENST00000635555 R4GN34 69 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00466-210ENST00000635555 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.53□□□□□ -1.84
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP10-10P60014 251 aa3.52□□□□□ -1.85
LINC00466-210ENST00000635555 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC00466-210ENST00000635555 K7ERS5 55 aa3.47□□□□□ -1.85
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
LINC00466-210ENST00000635555 USH2AO75445 5202 aa3.46□□□□□ -1.86
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.45□□□□□ -1.86
LINC00466-210ENST00000635555 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.45□□□□□ -1.86
LINC00466-210ENST00000635555 ROMO1P60602 79 aa3.43□□□□□ -1.86
LINC00466-210ENST00000635555 LINC01554Q52M75 96 aa3.43□□□□□ -1.86
LINC00466-210ENST00000635555 SSPOA2VEC9 5147 aa3.43□□□□□ -1.86
LINC00466-210ENST00000635555 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00466-210ENST00000635555 MT1BP07438 61 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00466-210ENST00000635555 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.32□□□□□ -1.88
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.31□□□□□ -1.88
LINC00466-210ENST00000635555 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
LINC00466-210ENST00000635555 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
LINC00466-210ENST00000635555 LCE1CQ5T751 118 aa3.3□□□□□ -1.88
LINC00466-210ENST00000635555 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.3□□□□□ -1.88
LINC00466-210ENST00000635555 PLAC4Q8WY50 150 aa3.3□□□□□ -1.88
LINC00466-210ENST00000635555 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.29□□□□□ -1.88
LINC00466-210ENST00000635555 MT1XP80297 61 aa3.28□□□□□ -1.88
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.28□□□□□ -1.88
LINC00466-210ENST00000635555 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.21□□□□□ -1.9
LINC00466-210ENST00000635555 TNP1P09430 55 aa3.2□□□□□ -1.9
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.19□□□□□ -1.9
LINC00466-210ENST00000635555 PP632Q6XCG6 107 aa3.18□□□□□ -1.9
LINC00466-210ENST00000635555 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.09□□□□□ -1.91
LINC00466-210ENST00000635555 NEBP20929 6669 aa3.07□□□□□ -1.92
LINC00466-210ENST00000635555 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.04□□□□□ -1.92
LINC00466-210ENST00000635555 KMT2DO14686 5537 aa3.01□□□□□ -1.93
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3□□□□□ -1.93
LINC00466-210ENST00000635555 LUZP6Q538Z0 58 aa2.97□□□□□ -1.93
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP12-3P60328 96 aa2.96□□□□□ -1.94
LINC00466-210ENST00000635555 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.96□□□□□ -1.94
LINC00466-210ENST00000635555 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.95□□□□□ -1.94
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.95□□□□□ -1.94
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.94□□□□□ -1.94
LINC00466-210ENST00000635555 MDN1Q9NU22 5596 aa2.94□□□□□ -1.94
LINC00466-210ENST00000635555 SPRR2EP22531 72 aa2.93□□□□□ -1.94
LINC00466-210ENST00000635555 SPRR2BP35325 72 aa2.93□□□□□ -1.94
LINC00466-210ENST00000635555 SPRR2AP35326 72 aa2.93□□□□□ -1.94
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.9□□□□□ -1.95
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.9□□□□□ -1.95
LINC00466-210ENST00000635555 MT1EP04732 61 aa2.87□□□□□ -1.95
LINC00466-210ENST00000635555 SPRR2DP22532 72 aa2.83□□□□□ -1.96
LINC00466-210ENST00000635555 MT1LQ93083 61 aa2.82□□□□□ -1.96
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.81□□□□□ -1.96
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.72□□□□□ -1.97
LINC00466-210ENST00000635555 MT1GP13640 62 aa2.71□□□□□ -1.98
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.71□□□□□ -1.98
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP5-8O75690 187 aa2.7□□□□□ -1.98
LINC00466-210ENST00000635555 MT1MQ8N339 61 aa2.68□□□□□ -1.98
LINC00466-210ENST00000635555 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
LINC00466-210ENST00000635555 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.63□□□□□ -1.99
LINC00466-210ENST00000635555 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.52□□□□□ -2.01
LINC00466-210ENST00000635555 MT4P47944 62 aa2.48□□□□□ -2.01
LINC00466-210ENST00000635555 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.41□□□□□ -2.02
LINC00466-210ENST00000635555 MT1AP04731 61 aa2.39□□□□□ -2.03
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.36□□□□□ -2.03
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP12-4P60329 112 aa2.34□□□□□ -2.03
LINC00466-210ENST00000635555 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.34□□□□□ -2.04
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.33□□□□□ -2.04
LINC00466-210ENST00000635555 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.31□□□□□ -2.04
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.27□□□□□ -2.05
LINC00466-210ENST00000635555 INE1O15225 51 aa2.25□□□□□ -2.05
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.15□□□□□ -2.07
LINC00466-210ENST00000635555 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
LINC00466-210ENST00000635555 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
LINC00466-210ENST00000635555 MUC5ACP98088 5654 aa1.93□□□□□ -2.1
LINC00466-210ENST00000635555 PRM1P04553 51 aa1.79□□□□□ -2.12
LINC00466-210ENST00000635555 PHGR1C9JFL3 82 aa1.39□□□□□ -2.19
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.17□□□□□ -2.22
LINC00466-210ENST00000635555 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms