RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.42	□□□□□ -1.54
BBS1-225	ENST00000630659	MT1E	P04732	61 aa		5.37	□□□□□ -1.55
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.32	□□□□□ -1.56
BBS1-225	ENST00000630659	MT1L	Q93083	61 aa		5.29	□□□□□ -1.56
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.27	□□□□□ -1.57
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
BBS1-225	ENST00000630659	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
BBS1-225	ENST00000630659	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.15	□□□□□ -1.58
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.15	□□□□□ -1.58
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.13	□□□□□ -1.59
BBS1-225	ENST00000630659	MT1G	P13640	62 aa		5.1	□□□□□ -1.59
BBS1-225	ENST00000630659	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.1	□□□□□ -1.59
BBS1-225	ENST00000630659	MT1M	Q8N339	61 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS1-225	ENST00000630659	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS1-225	ENST00000630659	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS1-225	ENST00000630659	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-225	ENST00000630659	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS1-225	ENST00000630659	SPRR2E	P22531	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS1-225	ENST00000630659	SPRR2B	P35325	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS1-225	ENST00000630659	SPRR2A	P35326	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS1-225	ENST00000630659	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BBS1-225	ENST00000630659	NEB	P20929	6669 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS1-225	ENST00000630659	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BBS1-225	ENST00000630659	SPRR2D	P22532	72 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS1-225	ENST00000630659	MT1A	P04731	61 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBS1-225	ENST00000630659	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.47	□□□□□ -1.69
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.46	□□□□□ -1.7
BBS1-225	ENST00000630659	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.4	□□□□□ -1.7
BBS1-225	ENST00000630659	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.38	□□□□□ -1.71
BBS1-225	ENST00000630659	PRM1	P04553	51 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-225	ENST00000630659	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BBS1-225	ENST00000630659	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS1-225	ENST00000630659	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-225	ENST00000630659	MT3	P25713	68 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-225	ENST00000630659	MT4	P47944	62 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBS1-225	ENST00000630659	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.95	□□□□□ -1.78
BBS1-225	ENST00000630659	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.9	□□□□□ -1.78
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.82	□□□□□ -1.8
BBS1-225	ENST00000630659	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.71	□□□□□ -1.82
BBS1-225	ENST00000630659	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.67	□□□□□ -1.82
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.64	□□□□□ -1.83
BBS1-225	ENST00000630659	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.4	□□□□□ -1.86
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBS1-225	ENST00000630659	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BBS1-225	ENST00000630659	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BBS1-225	ENST00000630659	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.25	□□□□□ -1.89
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.25	□□□□□ -1.89
BBS1-225	ENST00000630659	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
BBS1-225	ENST00000630659	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.91	□□□□□ -1.94
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.91	□□□□□ -1.94
BBS1-225	ENST00000630659	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.89	□□□□□ -1.95
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.89	□□□□□ -1.95
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.85	□□□□□ -1.95
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.8	□□□□□ -1.96
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BBS1-225	ENST00000630659	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.44	□□□□□ -2.02
BBS1-225	ENST00000630659	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.21	□□□□□ -2.06
BBS1-225	ENST00000630659	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.64	□□□□□ -2.15

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