RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 MUC2Q02817 5179 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 MT1MQ8N339 61 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 MT3P25713 68 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 MT4P47944 62 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 MT1AP04731 61 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6□□□□□ -1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6□□□□□ -1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6□□□□□ -1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 USH2AO75445 5202 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 PRM1P04553 51 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE1DQ5T752 114 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 KMT2DO14686 5537 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE4AQ5TA78 99 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 SSPOA2VEC9 5147 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-9P26371 169 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 MDN1Q9NU22 5596 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 NEBP20929 6669 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE1CQ5T751 118 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE1EQ5T753 118 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE1FQ5T754 118 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MUC5ACP98088 5654 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-8O75690 187 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRJ-208ENST00000615445 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRJ-208ENST00000615445 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PHGR1C9JFL3 82 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.65□□□□□ -1.98
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRJ-208ENST00000615445 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 336.8 ms