RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
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TNS1-220ENST00000611415 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.8□□□□□ -2.12
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.79□□□□□ -2.12
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.73□□□□□ -2.13
TNS1-220ENST00000611415 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.63□□□□□ -2.15
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.58□□□□□ -2.16
TNS1-220ENST00000611415 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.57□□□□□ -2.16
TNS1-220ENST00000611415 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.07□□□□□ -2.24
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