RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 PLAC4Q8WY50 150 aa4.02□□□□□ -1.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.01□□□□□ -1.77
EFTUD2-222ENST00000592408 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.99□□□□□ -1.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MT1HP80294 61 aa3.98□□□□□ -1.77
EFTUD2-222ENST00000592408 LUZP6Q538Z0 58 aa3.96□□□□□ -1.78
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.95□□□□□ -1.78
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-10P60014 251 aa3.92□□□□□ -1.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MT2AP02795 61 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-222ENST00000592408 MT1FP04733 61 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-222ENST00000592408 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.84□□□□□ -1.79
EFTUD2-222ENST00000592408 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.74□□□□□ -1.81
EFTUD2-222ENST00000592408 MT1BP07438 61 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE3AQ5TA76 89 aa3.72□□□□□ -1.81
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.7□□□□□ -1.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MT1XP80297 61 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.65□□□□□ -1.83
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-222ENST00000592408 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.61□□□□□ -1.83
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP12-3P60328 96 aa3.59□□□□□ -1.83
EFTUD2-222ENST00000592408 USH2AO75445 5202 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-222ENST00000592408 SSPOA2VEC9 5147 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-222ENST00000592408 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-222ENST00000592408 INE1O15225 51 aa3.3□□□□□ -1.88
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.27□□□□□ -1.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MT1EP04732 61 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.22□□□□□ -1.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MT1LQ93083 61 aa3.21□□□□□ -1.9
EFTUD2-222ENST00000592408 KMT2DO14686 5537 aa3.11□□□□□ -1.91
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.09□□□□□ -1.91
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.09□□□□□ -1.91
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.09□□□□□ -1.91
EFTUD2-222ENST00000592408 MT1GP13640 62 aa3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE1CQ5T751 118 aa3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-222ENST00000592408 NEBP20929 6669 aa3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MT1MQ8N339 61 aa3.03□□□□□ -1.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.02□□□□□ -1.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.98□□□□□ -1.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MDN1Q9NU22 5596 aa2.93□□□□□ -1.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRR2EP22531 72 aa2.92□□□□□ -1.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRR2BP35325 72 aa2.92□□□□□ -1.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRR2AP35326 72 aa2.92□□□□□ -1.94
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.92□□□□□ -1.94
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-8O75690 187 aa2.84□□□□□ -1.95
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRR2DP22532 72 aa2.83□□□□□ -1.96
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.81□□□□□ -1.96
EFTUD2-222ENST00000592408 MT1AP04731 61 aa2.75□□□□□ -1.97
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP12-4P60329 112 aa2.68□□□□□ -1.98
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.68□□□□□ -1.98
EFTUD2-222ENST00000592408 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-222ENST00000592408 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.62□□□□□ -1.99
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.57□□□□□ -2
EFTUD2-222ENST00000592408 MT4P47944 62 aa2.46□□□□□ -2.02
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.43□□□□□ -2.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.4□□□□□ -2.03
EFTUD2-222ENST00000592408 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.38□□□□□ -2.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PRM1P04553 51 aa2.36□□□□□ -2.03
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.32□□□□□ -2.04
EFTUD2-222ENST00000592408 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.31□□□□□ -2.04
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.27□□□□□ -2.05
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.25□□□□□ -2.05
EFTUD2-222ENST00000592408 MUC5ACP98088 5654 aa1.98□□□□□ -2.09
EFTUD2-222ENST00000592408 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
EFTUD2-222ENST00000592408 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.49□□□□□ -2.17
EFTUD2-222ENST00000592408 PHGR1C9JFL3 82 aa1.43□□□□□ -2.18
EFTUD2-222ENST00000592408 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms