RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.3□□□□□ -1.56
CTIF-210ENST00000591412 SPRR2DP22532 72 aa5.28□□□□□ -1.56
CTIF-210ENST00000591412 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.28□□□□□ -1.56
CTIF-210ENST00000591412 LCE3BQ5TA77 95 aa5.16□□□□□ -1.58
CTIF-210ENST00000591412 TNP1P09430 55 aa5.08□□□□□ -1.6
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.02□□□□□ -1.61
CTIF-210ENST00000591412 PP632Q6XCG6 107 aa5.01□□□□□ -1.61
CTIF-210ENST00000591412 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.99□□□□□ -1.61
CTIF-210ENST00000591412 MT1EP04732 61 aa4.98□□□□□ -1.61
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.97□□□□□ -1.61
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.95□□□□□ -1.62
CTIF-210ENST00000591412 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.84□□□□□ -1.63
CTIF-210ENST00000591412 LCE3AQ5TA76 89 aa4.84□□□□□ -1.63
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.83□□□□□ -1.64
CTIF-210ENST00000591412 MT1GP13640 62 aa4.81□□□□□ -1.64
CTIF-210ENST00000591412 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.81□□□□□ -1.64
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.74□□□□□ -1.65
CTIF-210ENST00000591412 MT1MQ8N339 61 aa4.73□□□□□ -1.65
CTIF-210ENST00000591412 MT1LQ93083 61 aa4.73□□□□□ -1.65
CTIF-210ENST00000591412 LCE1DQ5T752 114 aa4.71□□□□□ -1.66
CTIF-210ENST00000591412 LCE4AQ5TA78 99 aa4.68□□□□□ -1.66
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP12-3P60328 96 aa4.64□□□□□ -1.67
CTIF-210ENST00000591412 MT4P47944 62 aa4.63□□□□□ -1.67
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.63□□□□□ -1.67
CTIF-210ENST00000591412 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.63□□□□□ -1.67
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.6□□□□□ -1.67
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.51□□□□□ -1.69
CTIF-210ENST00000591412 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.5□□□□□ -1.69
CTIF-210ENST00000591412 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.5□□□□□ -1.69
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.5□□□□□ -1.69
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.45□□□□□ -1.7
CTIF-210ENST00000591412 NDUFAF8A1L188 74 aa4.42□□□□□ -1.7
CTIF-210ENST00000591412 LUZP6Q538Z0 58 aa4.42□□□□□ -1.7
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
CTIF-210ENST00000591412 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.35□□□□□ -1.71
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.33□□□□□ -1.72
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.33□□□□□ -1.72
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.31□□□□□ -1.72
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.29□□□□□ -1.72
CTIF-210ENST00000591412 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.26□□□□□ -1.73
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP12-4P60329 112 aa4.24□□□□□ -1.73
CTIF-210ENST00000591412 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.11□□□□□ -1.75
CTIF-210ENST00000591412 H3BS24 57 aa4.11□□□□□ -1.75
CTIF-210ENST00000591412 MT1AP04731 61 aa4.02□□□□□ -1.77
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.02□□□□□ -1.77
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.01□□□□□ -1.77
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.98□□□□□ -1.77
CTIF-210ENST00000591412 A0A0A0MQY5 61 aa3.93□□□□□ -1.78
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.9□□□□□ -1.79
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP5-8O75690 187 aa3.86□□□□□ -1.79
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.84□□□□□ -1.79
CTIF-210ENST00000591412 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
CTIF-210ENST00000591412 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CTIF-210ENST00000591412 MUC5ACP98088 5654 aa3.72□□□□□ -1.81
CTIF-210ENST00000591412 MT3P25713 68 aa3.67□□□□□ -1.82
CTIF-210ENST00000591412 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.67□□□□□ -1.82
CTIF-210ENST00000591412 INE1O15225 51 aa3.66□□□□□ -1.82
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.65□□□□□ -1.83
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.62□□□□□ -1.83
CTIF-210ENST00000591412 LCE1EQ5T753 118 aa3.42□□□□□ -1.86
CTIF-210ENST00000591412 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.28□□□□□ -1.88
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.25□□□□□ -1.89
CTIF-210ENST00000591412 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.22□□□□□ -1.89
CTIF-210ENST00000591412 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.2□□□□□ -1.9
CTIF-210ENST00000591412 LCE1CQ5T751 118 aa3.17□□□□□ -1.9
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.96□□□□□ -1.94
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.88□□□□□ -1.95
CTIF-210ENST00000591412 PRM1P04553 51 aa2.87□□□□□ -1.95
CTIF-210ENST00000591412 LCE1FQ5T754 118 aa2.82□□□□□ -1.96
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.65□□□□□ -1.99
CTIF-210ENST00000591412 PHGR1C9JFL3 82 aa2.57□□□□□ -2
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.42□□□□□ -2.02
CTIF-210ENST00000591412 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.27□□□□□ -2.05
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.96□□□□□ -2.1
CTIF-210ENST00000591412 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.66□□□□□ -2.14
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