RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 MT1LQ93083 61 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-9P26371 169 aa8.04□□□□□ -1.12
CAPNS1-207ENST00000589146 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.04□□□□□ -1.12
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-207ENST00000589146 MDN1Q9NU22 5596 aa7.96□□□□□ -1.14
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-207ENST00000589146 MT1GP13640 62 aa7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-207ENST00000589146 MT1MQ8N339 61 aa7.79□□□□□ -1.16
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.79□□□□□ -1.16
CAPNS1-207ENST00000589146 LUZP6Q538Z0 58 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-207ENST00000589146 SPRR2EP22531 72 aa7.63□□□□□ -1.19
CAPNS1-207ENST00000589146 SPRR2BP35325 72 aa7.63□□□□□ -1.19
CAPNS1-207ENST00000589146 SPRR2AP35326 72 aa7.63□□□□□ -1.19
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFAF8A1L188 74 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-207ENST00000589146 SPRR2DP22532 72 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE3BQ5TA77 95 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-207ENST00000589146 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR98Q8WXG9 6306 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-207ENST00000589146 MT1AP04731 61 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.81□□□□□ -1.32
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0A0MQY5 61 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BS24 57 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE1DQ5T752 114 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE4AQ5TA78 99 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-207ENST00000589146 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP12-4P60329 112 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 MT4P47944 62 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 INE1O15225 51 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MT3P25713 68 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.1□□□□□ -1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.53□□□□□ -1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE1EQ5T753 118 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-8O75690 187 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MUC5ACP98088 5654 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PRM1P04553 51 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE1CQ5T751 118 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.16□□□□□ -1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 LCE1FQ5T754 118 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 PHGR1C9JFL3 82 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.17□□□□□ -1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms