RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557021.5

UBE2V1-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 5 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	MT1E	P04732	61 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.9	□□□□□ -1.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SPRR2D	P22532	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2V1-222	ENST00000557021	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBE2V1-222	ENST00000557021	MT1L	Q93083	61 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE2V1-222	ENST00000557021	MT1G	P13640	62 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBE2V1-222	ENST00000557021	MT1M	Q8N339	61 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBE2V1-222	ENST00000557021	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2V1-222	ENST00000557021		H3BS24	57 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE2V1-222	ENST00000557021	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.46	□□□□□ -1.7
UBE2V1-222	ENST00000557021	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.44	□□□□□ -1.7
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.39	□□□□□ -1.71
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UBE2V1-222	ENST00000557021	MT4	P47944	62 aa		4.3	□□□□□ -1.72
UBE2V1-222	ENST00000557021	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBE2V1-222	ENST00000557021	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.21	□□□□□ -1.73
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBE2V1-222	ENST00000557021		A0A0A0MQY5	61 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UBE2V1-222	ENST00000557021	MT1A	P04731	61 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UBE2V1-222	ENST00000557021	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4	□□□□□ -1.77
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.94	□□□□□ -1.78
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.94	□□□□□ -1.78
UBE2V1-222	ENST00000557021	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.87	□□□□□ -1.79
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.87	□□□□□ -1.79
UBE2V1-222	ENST00000557021	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.81	□□□□□ -1.8
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBE2V1-222	ENST00000557021	INE1	O15225	51 aa		3.72	□□□□□ -1.81
UBE2V1-222	ENST00000557021	MT3	P25713	68 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.68	□□□□□ -1.82
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.45	□□□□□ -1.86
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.42	□□□□□ -1.86
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBE2V1-222	ENST00000557021	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.31	□□□□□ -1.88
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.24	□□□□□ -1.89
UBE2V1-222	ENST00000557021	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.22	□□□□□ -1.89
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UBE2V1-222	ENST00000557021	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
UBE2V1-222	ENST00000557021	PRM1	P04553	51 aa		2.87	□□□□□ -1.95
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.71	□□□□□ -1.98
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.67	□□□□□ -1.98
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.54	□□□□□ -2
UBE2V1-222	ENST00000557021	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.48	□□□□□ -2.01
UBE2V1-222	ENST00000557021	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.39	□□□□□ -2.03
UBE2V1-222	ENST00000557021	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.36	□□□□□ -2.03
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.79	□□□□□ -2.12
UBE2V1-222	ENST00000557021	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.47	□□□□□ -2.17

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