RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549311.7

TNS2-208, Transcript of tensin 2, human

TSL 5

Gene TNS2, Length 5,004 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS2-208	ENST00000549311	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TNS2-208	ENST00000549311	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TNS2-208	ENST00000549311	MT1M	Q8N339	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNS2-208	ENST00000549311	PRM1	P04553	51 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS2-208	ENST00000549311	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNS2-208	ENST00000549311	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS2-208	ENST00000549311	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TNS2-208	ENST00000549311	MT3	P25713	68 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TNS2-208	ENST00000549311	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNS2-208	ENST00000549311	MUC2	Q02817	5179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TNS2-208	ENST00000549311	MT4	P47944	62 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TNS2-208	ENST00000549311	MT1A	P04731	61 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS2-208	ENST00000549311	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS2-208	ENST00000549311	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.31	□□□□□ -1.72
TNS2-208	ENST00000549311	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TNS2-208	ENST00000549311	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.28	□□□□□ -1.72
TNS2-208	ENST00000549311	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TNS2-208	ENST00000549311	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TNS2-208	ENST00000549311	USH2A	O75445	5202 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.21	□□□□□ -1.73
TNS2-208	ENST00000549311	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TNS2-208	ENST00000549311	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TNS2-208	ENST00000549311	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TNS2-208	ENST00000549311	KMT2D	O14686	5537 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS2-208	ENST00000549311	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TNS2-208	ENST00000549311	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TNS2-208	ENST00000549311	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TNS2-208	ENST00000549311	NEB	P20929	6669 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TNS2-208	ENST00000549311	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TNS2-208	ENST00000549311	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TNS2-208	ENST00000549311	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TNS2-208	ENST00000549311	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TNS2-208	ENST00000549311	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TNS2-208	ENST00000549311	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TNS2-208	ENST00000549311	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TNS2-208	ENST00000549311	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TNS2-208	ENST00000549311	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.58	□□□□□ -2
TNS2-208	ENST00000549311	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.4	□□□□□ -2.03
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.4	□□□□□ -2.03
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.39	□□□□□ -2.03
TNS2-208	ENST00000549311	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.3	□□□□□ -2.04
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.26	□□□□□ -2.05
TNS2-208	ENST00000549311	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.24	□□□□□ -2.05
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.19	□□□□□ -2.06
TNS2-208	ENST00000549311	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.02	□□□□□ -2.09
TNS2-208	ENST00000549311	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.37	□□□□□ -2.19

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