RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.29□□□□□ -1.88
CS-204ENST00000546621 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.28□□□□□ -1.88
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.25□□□□□ -1.89
CS-204ENST00000546621 MT1BP07438 61 aa3.24□□□□□ -1.89
CS-204ENST00000546621 TNP1P09430 55 aa3.22□□□□□ -1.89
CS-204ENST00000546621 LCE1EQ5T753 118 aa3.19□□□□□ -1.9
CS-204ENST00000546621 MT1XP80297 61 aa3.16□□□□□ -1.9
CS-204ENST00000546621 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
CS-204ENST00000546621 KRTAP10-5P60370 271 aa3.15□□□□□ -1.9
CS-204ENST00000546621 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CS-204ENST00000546621 SSPOA2VEC9 5147 aa3.12□□□□□ -1.91
CS-204ENST00000546621 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CS-204ENST00000546621 USH2AO75445 5202 aa3.1□□□□□ -1.91
CS-204ENST00000546621 MT3P25713 68 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-204ENST00000546621 LCE3AQ5TA76 89 aa3.05□□□□□ -1.92
CS-204ENST00000546621 KRTAP10-12P60413 245 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-204ENST00000546621 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-204ENST00000546621 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3□□□□□ -1.93
CS-204ENST00000546621 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.99□□□□□ -1.93
CS-204ENST00000546621 NEBP20929 6669 aa2.98□□□□□ -1.93
CS-204ENST00000546621 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.95□□□□□ -1.94
CS-204ENST00000546621 KMT2DO14686 5537 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-204ENST00000546621 KRTAP12-3P60328 96 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-204ENST00000546621 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.88□□□□□ -1.95
CS-204ENST00000546621 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.85□□□□□ -1.95
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.83□□□□□ -1.96
CS-204ENST00000546621 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-204ENST00000546621 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-204ENST00000546621 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-204ENST00000546621 MT1EP04732 61 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.76□□□□□ -1.97
CS-204ENST00000546621 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.76□□□□□ -1.97
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-9P26371 169 aa2.74□□□□□ -1.97
CS-204ENST00000546621 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.74□□□□□ -1.97
CS-204ENST00000546621 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.73□□□□□ -1.97
CS-204ENST00000546621 MT1LQ93083 61 aa2.73□□□□□ -1.97
CS-204ENST00000546621 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.71□□□□□ -1.98
CS-204ENST00000546621 MDN1Q9NU22 5596 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-204ENST00000546621 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.67□□□□□ -1.98
CS-204ENST00000546621 SPRR2EP22531 72 aa2.64□□□□□ -1.99
CS-204ENST00000546621 SPRR2BP35325 72 aa2.64□□□□□ -1.99
CS-204ENST00000546621 SPRR2AP35326 72 aa2.64□□□□□ -1.99
CS-204ENST00000546621 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.64□□□□□ -1.99
CS-204ENST00000546621 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.63□□□□□ -1.99
CS-204ENST00000546621 LCE1FQ5T754 118 aa2.63□□□□□ -1.99
CS-204ENST00000546621 MT1GP13640 62 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-204ENST00000546621 MT1MQ8N339 61 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-204ENST00000546621 SPRR2DP22532 72 aa2.56□□□□□ -2
CS-204ENST00000546621 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.55□□□□□ -2
CS-204ENST00000546621 KRTAP12-4P60329 112 aa2.46□□□□□ -2.02
CS-204ENST00000546621 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CS-204ENST00000546621 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
CS-204ENST00000546621 MT1AP04731 61 aa2.31□□□□□ -2.04
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-204ENST00000546621 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-204ENST00000546621 MT4P47944 62 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-204ENST00000546621 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-204ENST00000546621 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-204ENST00000546621 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CS-204ENST00000546621 PRM1P04553 51 aa2.24□□□□□ -2.05
CS-204ENST00000546621 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.24□□□□□ -2.05
CS-204ENST00000546621 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.12□□□□□ -2.07
CS-204ENST00000546621 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.1□□□□□ -2.07
CS-204ENST00000546621 LCE1CQ5T751 118 aa2.07□□□□□ -2.08
CS-204ENST00000546621 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.07□□□□□ -2.08
CS-204ENST00000546621 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.03□□□□□ -2.08
CS-204ENST00000546621 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
CS-204ENST00000546621 MUC5ACP98088 5654 aa1.97□□□□□ -2.09
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-8O75690 187 aa1.94□□□□□ -2.1
CS-204ENST00000546621 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
CS-204ENST00000546621 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.66□□□□□ -2.14
CS-204ENST00000546621 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.56□□□□□ -2.16
CS-204ENST00000546621 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.5□□□□□ -2.17
CS-204ENST00000546621 PHGR1C9JFL3 82 aa1.4□□□□□ -2.18
CS-204ENST00000546621 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.85□□□□□ -2.27
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