RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537075.2

KCNS1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.85□□□□□ -1.15
KCNS1-202ENST00000537075 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.75□□□□□ -1.17
KCNS1-202ENST00000537075 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.61□□□□□ -1.19
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.57□□□□□ -1.2
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.57□□□□□ -1.2
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.57□□□□□ -1.2
KCNS1-202ENST00000537075 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-9P26371 169 aa7.51□□□□□ -1.21
KCNS1-202ENST00000537075 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.5□□□□□ -1.21
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.48□□□□□ -1.21
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.48□□□□□ -1.21
KCNS1-202ENST00000537075 MT1MQ8N339 61 aa7.45□□□□□ -1.22
KCNS1-202ENST00000537075 MT1GP13640 62 aa7.42□□□□□ -1.22
KCNS1-202ENST00000537075 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.39□□□□□ -1.23
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.37□□□□□ -1.23
KCNS1-202ENST00000537075 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.33□□□□□ -1.24
KCNS1-202ENST00000537075 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.27□□□□□ -1.25
KCNS1-202ENST00000537075 SPRR2EP22531 72 aa7.22□□□□□ -1.25
KCNS1-202ENST00000537075 SPRR2BP35325 72 aa7.22□□□□□ -1.25
KCNS1-202ENST00000537075 SPRR2AP35326 72 aa7.22□□□□□ -1.25
KCNS1-202ENST00000537075 MDN1Q9NU22 5596 aa7.19□□□□□ -1.26
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.1□□□□□ -1.27
KCNS1-202ENST00000537075 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
KCNS1-202ENST00000537075 SPRR2DP22532 72 aa6.95□□□□□ -1.3
KCNS1-202ENST00000537075 NEBP20929 6669 aa6.85□□□□□ -1.31
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.71□□□□□ -1.34
KCNS1-202ENST00000537075 LCE3BQ5TA77 95 aa6.7□□□□□ -1.34
KCNS1-202ENST00000537075 MT1AP04731 61 aa6.67□□□□□ -1.34
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP12-4P60329 112 aa6.57□□□□□ -1.36
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.54□□□□□ -1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.31□□□□□ -1.4
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.31□□□□□ -1.4
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.28□□□□□ -1.4
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.28□□□□□ -1.4
KCNS1-202ENST00000537075 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.26□□□□□ -1.41
KCNS1-202ENST00000537075 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNS1-202ENST00000537075 LCE4AQ5TA78 99 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNS1-202ENST00000537075 MT4P47944 62 aa6.04□□□□□ -1.44
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.04□□□□□ -1.44
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.99□□□□□ -1.45
KCNS1-202ENST00000537075 MT3P25713 68 aa5.96□□□□□ -1.45
KCNS1-202ENST00000537075 LCE1DQ5T752 114 aa5.93□□□□□ -1.46
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.87□□□□□ -1.47
KCNS1-202ENST00000537075 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.82□□□□□ -1.48
KCNS1-202ENST00000537075 PRM1P04553 51 aa5.79□□□□□ -1.48
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.7□□□□□ -1.5
KCNS1-202ENST00000537075 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.68□□□□□ -1.5
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.66□□□□□ -1.5
KCNS1-202ENST00000537075 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.14□□□□□ -1.59
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.09□□□□□ -1.59
KCNS1-202ENST00000537075 LCE1EQ5T753 118 aa5.08□□□□□ -1.6
KCNS1-202ENST00000537075 MUC5ACP98088 5654 aa5.03□□□□□ -1.6
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.93□□□□□ -1.62
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-8O75690 187 aa4.9□□□□□ -1.63
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.88□□□□□ -1.63
KCNS1-202ENST00000537075 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.8□□□□□ -1.64
KCNS1-202ENST00000537075 LCE1CQ5T751 118 aa4.74□□□□□ -1.65
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.74□□□□□ -1.65
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.74□□□□□ -1.65
KCNS1-202ENST00000537075 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.67□□□□□ -1.66
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.41□□□□□ -1.7
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.37□□□□□ -1.71
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.18□□□□□ -1.74
KCNS1-202ENST00000537075 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.95□□□□□ -1.78
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.92□□□□□ -1.78
KCNS1-202ENST00000537075 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
KCNS1-202ENST00000537075 LCE1FQ5T754 118 aa3.76□□□□□ -1.81
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.65□□□□□ -1.83
KCNS1-202ENST00000537075 PHGR1C9JFL3 82 aa3.58□□□□□ -1.84
KCNS1-202ENST00000537075 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.53□□□□□ -1.84
KCNS1-202ENST00000537075 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.32□□□□□ -2.04
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