RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 NEBP20929 6669 aa4.85□□□□□ -1.63
RPUSD4-208ENST00000533628 MDN1Q9NU22 5596 aa4.79□□□□□ -1.64
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.78□□□□□ -1.64
RPUSD4-208ENST00000533628 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.77□□□□□ -1.65
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RPUSD4-208ENST00000533628 SPRR2BP35325 72 aa4.75□□□□□ -1.65
RPUSD4-208ENST00000533628 SPRR2AP35326 72 aa4.75□□□□□ -1.65
RPUSD4-208ENST00000533628 LCE3AQ5TA76 89 aa4.74□□□□□ -1.65
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RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.71□□□□□ -1.65
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RPUSD4-208ENST00000533628 MT1LQ93083 61 aa4.55□□□□□ -1.68
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.54□□□□□ -1.68
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.54□□□□□ -1.68
RPUSD4-208ENST00000533628 MT1GP13640 62 aa4.52□□□□□ -1.69
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RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.36□□□□□ -1.71
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RPUSD4-208ENST00000533628 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.1□□□□□ -1.75
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RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.66□□□□□ -1.82
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RPUSD4-208ENST00000533628 MT3P25713 68 aa3.51□□□□□ -1.85
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RPUSD4-208ENST00000533628 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RPUSD4-208ENST00000533628 LCE1FQ5T754 118 aa2.66□□□□□ -1.98
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.64□□□□□ -1.99
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.54□□□□□ -2
RPUSD4-208ENST00000533628 PHGR1C9JFL3 82 aa2.27□□□□□ -2.05
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.26□□□□□ -2.05
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.18□□□□□ -2.06
RPUSD4-208ENST00000533628 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.99□□□□□ -2.09
RPUSD4-208ENST00000533628 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.49□□□□□ -2.17
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