RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495522.1

CALD1-222, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CALD1, Length 2,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-222	ENST00000495522	MT1L	Q93083	61 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CALD1-222	ENST00000495522	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CALD1-222	ENST00000495522	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CALD1-222	ENST00000495522	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CALD1-222	ENST00000495522	MT1G	P13640	62 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CALD1-222	ENST00000495522	MT1M	Q8N339	61 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CALD1-222	ENST00000495522	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CALD1-222	ENST00000495522	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5	□□□□□ -1.61
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALD1-222	ENST00000495522	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALD1-222	ENST00000495522	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALD1-222	ENST00000495522	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALD1-222	ENST00000495522	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALD1-222	ENST00000495522	SPRR2E	P22531	72 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALD1-222	ENST00000495522	SPRR2B	P35325	72 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALD1-222	ENST00000495522	SPRR2A	P35326	72 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALD1-222	ENST00000495522	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CALD1-222	ENST00000495522	SPRR2D	P22532	72 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CALD1-222	ENST00000495522	NEB	P20929	6669 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CALD1-222	ENST00000495522	MT1A	P04731	61 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CALD1-222	ENST00000495522	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
CALD1-222	ENST00000495522	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CALD1-222	ENST00000495522	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CALD1-222	ENST00000495522	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.21	□□□□□ -1.73
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CALD1-222	ENST00000495522	MT3	P25713	68 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CALD1-222	ENST00000495522	PRM1	P04553	51 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CALD1-222	ENST00000495522	MT4	P47944	62 aa		4	□□□□□ -1.77
CALD1-222	ENST00000495522	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CALD1-222	ENST00000495522	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CALD1-222	ENST00000495522	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALD1-222	ENST00000495522	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CALD1-222	ENST00000495522	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.31	□□□□□ -1.88
CALD1-222	ENST00000495522	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.27	□□□□□ -1.89
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.24	□□□□□ -1.89
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.24	□□□□□ -1.89
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.24	□□□□□ -1.89
CALD1-222	ENST00000495522	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CALD1-222	ENST00000495522	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CALD1-222	ENST00000495522	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3	□□□□□ -1.93
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CALD1-222	ENST00000495522	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CALD1-222	ENST00000495522	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CALD1-222	ENST00000495522	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
CALD1-222	ENST00000495522	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.41	□□□□□ -2.02
CALD1-222	ENST00000495522	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.37	□□□□□ -2.03
CALD1-222	ENST00000495522	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.59	□□□□□ -2.15

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