RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494120.1

C1orf109-211, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C1orf109, Length 2,570 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.26□□□□□ -1.57
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C1orf109-211ENST00000494120 MT1EP04732 61 aa5.18□□□□□ -1.58
C1orf109-211ENST00000494120 SSPOA2VEC9 5147 aa5.17□□□□□ -1.58
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C1orf109-211ENST00000494120 LCE3BQ5TA77 95 aa5.11□□□□□ -1.59
C1orf109-211ENST00000494120 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.1□□□□□ -1.59
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C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.51□□□□□ -1.69
C1orf109-211ENST00000494120 MDN1Q9NU22 5596 aa4.47□□□□□ -1.69
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C1orf109-211ENST00000494120 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.24□□□□□ -1.73
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C1orf109-211ENST00000494120 SPRR2EP22531 72 aa4.1□□□□□ -1.75
C1orf109-211ENST00000494120 SPRR2BP35325 72 aa4.1□□□□□ -1.75
C1orf109-211ENST00000494120 SPRR2AP35326 72 aa4.1□□□□□ -1.75
C1orf109-211ENST00000494120 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.1□□□□□ -1.75
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C1orf109-211ENST00000494120 SPRR2DP22532 72 aa3.91□□□□□ -1.78
C1orf109-211ENST00000494120 MT3P25713 68 aa3.9□□□□□ -1.78
C1orf109-211ENST00000494120 LCE1EQ5T753 118 aa3.89□□□□□ -1.79
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C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.08□□□□□ -1.92
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.07□□□□□ -1.92
C1orf109-211ENST00000494120 LCE1CQ5T751 118 aa2.98□□□□□ -1.93
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C1orf109-211ENST00000494120 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.66□□□□□ -1.98
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.65□□□□□ -1.99
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.62□□□□□ -1.99
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.62□□□□□ -1.99
C1orf109-211ENST00000494120 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
C1orf109-211ENST00000494120 PHGR1C9JFL3 82 aa2.2□□□□□ -2.06
C1orf109-211ENST00000494120 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
C1orf109-211ENST00000494120 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.45□□□□□ -2.18
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