RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493216.1

MED15-231, Transcript of mediator complex subunit 15, human

TSL 2

Gene MED15, Length 4,701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.33	□□□□□ -1.56
MED15-231	ENST00000493216	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
MED15-231	ENST00000493216	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
MED15-231	ENST00000493216	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED15-231	ENST00000493216	TNXB	P22105	4242 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MED15-231	ENST00000493216	RNF213	Q63HN8	5207 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MED15-231	ENST00000493216	MT4	P47944	62 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MED15-231	ENST00000493216	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED15-231	ENST00000493216	MT1A	P04731	61 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED15-231	ENST00000493216	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED15-231	ENST00000493216	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED15-231	ENST00000493216	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED15-231	ENST00000493216	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED15-231	ENST00000493216	MUC2	Q02817	5179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED15-231	ENST00000493216	PRM1	P04553	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED15-231	ENST00000493216	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED15-231	ENST00000493216	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED15-231	ENST00000493216	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED15-231	ENST00000493216	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MED15-231	ENST00000493216	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MED15-231	ENST00000493216	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED15-231	ENST00000493216	USH2A	O75445	5202 aa		4.41	□□□□□ -1.7
MED15-231	ENST00000493216	KMT2D	O14686	5537 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MED15-231	ENST00000493216	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MED15-231	ENST00000493216	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
MED15-231	ENST00000493216	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
MED15-231	ENST00000493216	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MED15-231	ENST00000493216	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MED15-231	ENST00000493216	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MED15-231	ENST00000493216	NEB	P20929	6669 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MED15-231	ENST00000493216	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4	□□□□□ -1.77
MED15-231	ENST00000493216	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4	□□□□□ -1.77
MED15-231	ENST00000493216	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		4	□□□□□ -1.77
MED15-231	ENST00000493216	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.93	□□□□□ -1.78
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MED15-231	ENST00000493216	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MED15-231	ENST00000493216	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.24	□□□□□ -1.89
MED15-231	ENST00000493216	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MED15-231	ENST00000493216	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.87	□□□□□ -1.95
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.86	□□□□□ -1.95
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MED15-231	ENST00000493216	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MED15-231	ENST00000493216	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MED15-231	ENST00000493216	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.56	□□□□□ -2
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.47	□□□□□ -2.01
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.39	□□□□□ -2.03
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.37	□□□□□ -2.03
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
MED15-231	ENST00000493216	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.12	□□□□□ -2.07
MED15-231	ENST00000493216	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.57	□□□□□ -2.16

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