RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.48□□□□□ -1.69
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.46□□□□□ -1.7
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.43□□□□□ -1.7
HDLBP-241ENST00000487169 MT1LQ93083 61 aa4.41□□□□□ -1.7
HDLBP-241ENST00000487169 MT1EP04732 61 aa4.39□□□□□ -1.71
HDLBP-241ENST00000487169 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.34□□□□□ -1.71
HDLBP-241ENST00000487169 USH2AO75445 5202 aa4.33□□□□□ -1.72
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.33□□□□□ -1.72
HDLBP-241ENST00000487169 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
HDLBP-241ENST00000487169 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.26□□□□□ -1.73
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.26□□□□□ -1.73
HDLBP-241ENST00000487169 MT1MQ8N339 61 aa4.25□□□□□ -1.73
HDLBP-241ENST00000487169 KMT2DO14686 5537 aa4.23□□□□□ -1.73
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.2□□□□□ -1.74
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.17□□□□□ -1.74
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.14□□□□□ -1.75
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.14□□□□□ -1.75
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.14□□□□□ -1.75
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.14□□□□□ -1.75
HDLBP-241ENST00000487169 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.13□□□□□ -1.75
HDLBP-241ENST00000487169 MT4P47944 62 aa4.11□□□□□ -1.75
HDLBP-241ENST00000487169 MT3P25713 68 aa4.1□□□□□ -1.75
HDLBP-241ENST00000487169 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
HDLBP-241ENST00000487169 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
HDLBP-241ENST00000487169 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
HDLBP-241ENST00000487169 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
HDLBP-241ENST00000487169 SSPOA2VEC9 5147 aa3.94□□□□□ -1.78
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.94□□□□□ -1.78
HDLBP-241ENST00000487169 MT1AP04731 61 aa3.92□□□□□ -1.78
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
HDLBP-241ENST00000487169 LCE1DQ5T752 114 aa3.9□□□□□ -1.78
HDLBP-241ENST00000487169 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.9□□□□□ -1.79
HDLBP-241ENST00000487169 PRM1P04553 51 aa3.85□□□□□ -1.79
HDLBP-241ENST00000487169 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.84□□□□□ -1.79
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.83□□□□□ -1.8
HDLBP-241ENST00000487169 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.83□□□□□ -1.8
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.79□□□□□ -1.8
HDLBP-241ENST00000487169 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.76□□□□□ -1.81
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.74□□□□□ -1.81
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.71□□□□□ -1.82
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.65□□□□□ -1.83
HDLBP-241ENST00000487169 MDN1Q9NU22 5596 aa3.62□□□□□ -1.83
HDLBP-241ENST00000487169 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.6□□□□□ -1.83
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.58□□□□□ -1.84
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.58□□□□□ -1.84
HDLBP-241ENST00000487169 LCE4AQ5TA78 99 aa3.56□□□□□ -1.84
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-9P26371 169 aa3.47□□□□□ -1.85
HDLBP-241ENST00000487169 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.42□□□□□ -1.86
HDLBP-241ENST00000487169 NEBP20929 6669 aa3.4□□□□□ -1.86
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HDLBP-241ENST00000487169 LCE1CQ5T751 118 aa3.25□□□□□ -1.89
HDLBP-241ENST00000487169 LCE1EQ5T753 118 aa3.25□□□□□ -1.89
HDLBP-241ENST00000487169 LCE1FQ5T754 118 aa3.25□□□□□ -1.89
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.17□□□□□ -1.9
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.08□□□□□ -1.92
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.08□□□□□ -1.92
HDLBP-241ENST00000487169 MUC5ACP98088 5654 aa2.9□□□□□ -1.95
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.88□□□□□ -1.95
HDLBP-241ENST00000487169 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.87□□□□□ -1.95
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.79□□□□□ -1.96
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.75□□□□□ -1.97
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.75□□□□□ -1.97
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.75□□□□□ -1.97
HDLBP-241ENST00000487169 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.72□□□□□ -1.97
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.64□□□□□ -1.99
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.55□□□□□ -2
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.41□□□□□ -2.02
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-8O75690 187 aa2.38□□□□□ -2.03
HDLBP-241ENST00000487169 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.22□□□□□ -2.05
HDLBP-241ENST00000487169 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.15□□□□□ -2.07
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.1□□□□□ -2.07
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.06□□□□□ -2.08
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.03□□□□□ -2.08
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
HDLBP-241ENST00000487169 PHGR1C9JFL3 82 aa2.02□□□□□ -2.09
HDLBP-241ENST00000487169 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 1365 ms