RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
USP20-204ENST00000472108 MT1LQ93083 61 aa5.82□□□□□ -1.48
USP20-204ENST00000472108 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.8□□□□□ -1.48
USP20-204ENST00000472108 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.79□□□□□ -1.48
USP20-204ENST00000472108 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.77□□□□□ -1.49
USP20-204ENST00000472108 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-9P26371 169 aa5.74□□□□□ -1.49
USP20-204ENST00000472108 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.7□□□□□ -1.5
USP20-204ENST00000472108 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.69□□□□□ -1.5
USP20-204ENST00000472108 MT1GP13640 62 aa5.67□□□□□ -1.5
USP20-204ENST00000472108 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.65□□□□□ -1.51
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.64□□□□□ -1.51
USP20-204ENST00000472108 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.6□□□□□ -1.51
USP20-204ENST00000472108 MT1MQ8N339 61 aa5.58□□□□□ -1.52
USP20-204ENST00000472108 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.55□□□□□ -1.52
USP20-204ENST00000472108 SPRR2EP22531 72 aa5.48□□□□□ -1.53
USP20-204ENST00000472108 SPRR2BP35325 72 aa5.48□□□□□ -1.53
USP20-204ENST00000472108 SPRR2AP35326 72 aa5.48□□□□□ -1.53
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.47□□□□□ -1.53
USP20-204ENST00000472108 NEBP20929 6669 aa5.47□□□□□ -1.53
USP20-204ENST00000472108 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.46□□□□□ -1.54
USP20-204ENST00000472108 MDN1Q9NU22 5596 aa5.42□□□□□ -1.54
USP20-204ENST00000472108 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.37□□□□□ -1.55
USP20-204ENST00000472108 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.34□□□□□ -1.55
USP20-204ENST00000472108 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.34□□□□□ -1.55
USP20-204ENST00000472108 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.34□□□□□ -1.55
USP20-204ENST00000472108 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.29□□□□□ -1.56
USP20-204ENST00000472108 SPRR2DP22532 72 aa5.28□□□□□ -1.56
USP20-204ENST00000472108 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
USP20-204ENST00000472108 LCE3BQ5TA77 95 aa5.08□□□□□ -1.6
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
USP20-204ENST00000472108 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5□□□□□ -1.61
USP20-204ENST00000472108 MT1AP04731 61 aa4.95□□□□□ -1.62
USP20-204ENST00000472108 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.9□□□□□ -1.63
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.81□□□□□ -1.64
USP20-204ENST00000472108 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP20-204ENST00000472108 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.71□□□□□ -1.66
USP20-204ENST00000472108 LCE4AQ5TA78 99 aa4.7□□□□□ -1.66
USP20-204ENST00000472108 KRTAP12-4P60329 112 aa4.67□□□□□ -1.66
USP20-204ENST00000472108 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.64□□□□□ -1.67
USP20-204ENST00000472108 MT4P47944 62 aa4.59□□□□□ -1.67
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.58□□□□□ -1.68
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.54□□□□□ -1.68
USP20-204ENST00000472108 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.51□□□□□ -1.69
USP20-204ENST00000472108 LCE1DQ5T752 114 aa4.51□□□□□ -1.69
USP20-204ENST00000472108 MT3P25713 68 aa4.49□□□□□ -1.69
USP20-204ENST00000472108 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.48□□□□□ -1.69
USP20-204ENST00000472108 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.38□□□□□ -1.71
USP20-204ENST00000472108 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.37□□□□□ -1.71
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.36□□□□□ -1.71
USP20-204ENST00000472108 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.35□□□□□ -1.71
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.32□□□□□ -1.72
USP20-204ENST00000472108 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.23□□□□□ -1.73
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.19□□□□□ -1.74
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.08□□□□□ -1.76
USP20-204ENST00000472108 PRM1P04553 51 aa4.04□□□□□ -1.76
USP20-204ENST00000472108 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.02□□□□□ -1.77
USP20-204ENST00000472108 LCE1EQ5T753 118 aa3.9□□□□□ -1.79
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.88□□□□□ -1.79
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.77□□□□□ -1.81
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-8O75690 187 aa3.74□□□□□ -1.81
USP20-204ENST00000472108 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.64□□□□□ -1.83
USP20-204ENST00000472108 LCE1CQ5T751 118 aa3.63□□□□□ -1.83
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.62□□□□□ -1.83
USP20-204ENST00000472108 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
USP20-204ENST00000472108 MUC5ACP98088 5654 aa3.54□□□□□ -1.84
USP20-204ENST00000472108 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
USP20-204ENST00000472108 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.47□□□□□ -1.85
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
USP20-204ENST00000472108 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.21□□□□□ -1.89
USP20-204ENST00000472108 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.19□□□□□ -1.9
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3□□□□□ -1.93
USP20-204ENST00000472108 LCE1FQ5T754 118 aa2.89□□□□□ -1.95
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.84□□□□□ -1.95
USP20-204ENST00000472108 PHGR1C9JFL3 82 aa2.75□□□□□ -1.97
USP20-204ENST00000472108 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.67□□□□□ -1.98
USP20-204ENST00000472108 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.39□□□□□ -2.03
USP20-204ENST00000472108 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.75□□□□□ -2.13
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