RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.31□□□□□ -0.92
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OPN3-204ENST00000469376 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa9.21□□□□□ -0.94
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa9.06□□□□□ -0.96
OPN3-204ENST00000469376 MT1EP04732 61 aa8.97□□□□□ -0.97
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.97□□□□□ -0.97
OPN3-204ENST00000469376 MT1LQ93083 61 aa8.97□□□□□ -0.97
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.9□□□□□ -0.99
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.87□□□□□ -0.99
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OPN3-204ENST00000469376 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.87□□□□□ -0.99
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OPN3-204ENST00000469376 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.5□□□□□ -1.05
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OPN3-204ENST00000469376 MT1MQ8N339 61 aa8.37□□□□□ -1.07
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OPN3-204ENST00000469376 SPRR2DP22532 72 aa8.13□□□□□ -1.11
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OPN3-204ENST00000469376 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.8□□□□□ -1.16
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OPN3-204ENST00000469376 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.43□□□□□ -1.22
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OPN3-204ENST00000469376 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.12□□□□□ -1.27
OPN3-204ENST00000469376 MT4P47944 62 aa7.09□□□□□ -1.27
OPN3-204ENST00000469376 LCE1DQ5T752 114 aa7.09□□□□□ -1.27
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OPN3-204ENST00000469376 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.82□□□□□ -1.32
OPN3-204ENST00000469376 MT3P25713 68 aa6.81□□□□□ -1.32
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.77□□□□□ -1.33
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OPN3-204ENST00000469376 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.16□□□□□ -1.42
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.12□□□□□ -1.43
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OPN3-204ENST00000469376 LCE1EQ5T753 118 aa5.81□□□□□ -1.48
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP5-8O75690 187 aa5.8□□□□□ -1.48
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.71□□□□□ -1.49
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OPN3-204ENST00000469376 LCE1CQ5T751 118 aa5.41□□□□□ -1.54
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OPN3-204ENST00000469376 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.91□□□□□ -1.62
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.79□□□□□ -1.64
OPN3-204ENST00000469376 LCE1FQ5T754 118 aa4.39□□□□□ -1.71
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.38□□□□□ -1.71
OPN3-204ENST00000469376 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.35□□□□□ -1.71
OPN3-204ENST00000469376 PHGR1C9JFL3 82 aa4.12□□□□□ -1.75
OPN3-204ENST00000469376 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.87□□□□□ -1.79
OPN3-204ENST00000469376 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.65□□□□□ -1.98
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