RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, human

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PREB-208	ENST00000468045	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PREB-208	ENST00000468045	SSPO	A2VEC9	5147 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PREB-208	ENST00000468045	MT1G	P13640	62 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PREB-208	ENST00000468045	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PREB-208	ENST00000468045	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PREB-208	ENST00000468045	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.65	□□□□□ -1.51
PREB-208	ENST00000468045	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PREB-208	ENST00000468045	MT1M	Q8N339	61 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PREB-208	ENST00000468045	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.46	□□□□□ -1.53
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PREB-208	ENST00000468045	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PREB-208	ENST00000468045	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
PREB-208	ENST00000468045	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PREB-208	ENST00000468045	PRM1	P04553	51 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PREB-208	ENST00000468045	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PREB-208	ENST00000468045	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PREB-208	ENST00000468045	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PREB-208	ENST00000468045	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PREB-208	ENST00000468045	MT1A	P04731	61 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PREB-208	ENST00000468045	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PREB-208	ENST00000468045	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PREB-208	ENST00000468045	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PREB-208	ENST00000468045	SPRR2E	P22531	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PREB-208	ENST00000468045	SPRR2B	P35325	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PREB-208	ENST00000468045	SPRR2A	P35326	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PREB-208	ENST00000468045	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PREB-208	ENST00000468045	SPRR2D	P22532	72 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PREB-208	ENST00000468045	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PREB-208	ENST00000468045	MT3	P25713	68 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PREB-208	ENST00000468045	NEB	P20929	6669 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PREB-208	ENST00000468045	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PREB-208	ENST00000468045	MT4	P47944	62 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PREB-208	ENST00000468045	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PREB-208	ENST00000468045	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.95	□□□□□ -1.78
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.94	□□□□□ -1.78
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.93	□□□□□ -1.78
PREB-208	ENST00000468045	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.92	□□□□□ -1.78
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PREB-208	ENST00000468045	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PREB-208	ENST00000468045	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PREB-208	ENST00000468045	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.27	□□□□□ -1.89
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.26	□□□□□ -1.89
PREB-208	ENST00000468045	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.23	□□□□□ -1.89
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PREB-208	ENST00000468045	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PREB-208	ENST00000468045	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PREB-208	ENST00000468045	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
PREB-208	ENST00000468045	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PREB-208	ENST00000468045	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.72	□□□□□ -2.13

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