RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 LCE3BQ5TA77 95 aa4.87□□□□□ -1.63
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.84□□□□□ -1.63
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.8□□□□□ -1.64
SOGA3-201ENST00000465909 LCE2BO14633 110 aa4.77□□□□□ -1.65
SOGA3-201ENST00000465909 MT1LQ93083 61 aa4.77□□□□□ -1.65
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.76□□□□□ -1.65
SOGA3-201ENST00000465909 PRM1P04553 51 aa4.68□□□□□ -1.66
SOGA3-201ENST00000465909 MT1EP04732 61 aa4.64□□□□□ -1.67
SOGA3-201ENST00000465909 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.64□□□□□ -1.67
SOGA3-201ENST00000465909 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.61□□□□□ -1.67
SOGA3-201ENST00000465909 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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SOGA3-201ENST00000465909 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.55□□□□□ -1.68
SOGA3-201ENST00000465909 SSPOA2VEC9 5147 aa4.52□□□□□ -1.69
SOGA3-201ENST00000465909 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.5□□□□□ -1.69
SOGA3-201ENST00000465909 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
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SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.4□□□□□ -1.71
SOGA3-201ENST00000465909 MT1MQ8N339 61 aa4.37□□□□□ -1.71
SOGA3-201ENST00000465909 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.31□□□□□ -1.72
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SOGA3-201ENST00000465909 SPRR2EP22531 72 aa4.21□□□□□ -1.74
SOGA3-201ENST00000465909 SPRR2BP35325 72 aa4.21□□□□□ -1.74
SOGA3-201ENST00000465909 SPRR2AP35326 72 aa4.21□□□□□ -1.74
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.2□□□□□ -1.74
SOGA3-201ENST00000465909 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.2□□□□□ -1.74
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.17□□□□□ -1.74
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.16□□□□□ -1.74
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.16□□□□□ -1.74
SOGA3-201ENST00000465909 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
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SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
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SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.64□□□□□ -1.83
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SOGA3-201ENST00000465909 LCE1FQ5T754 118 aa3.31□□□□□ -1.88
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP5-9P26371 169 aa3.31□□□□□ -1.88
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SOGA3-201ENST00000465909 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.05□□□□□ -1.92
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SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.96□□□□□ -1.94
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SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.83□□□□□ -1.96
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SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.75□□□□□ -1.97
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.75□□□□□ -1.97
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.71□□□□□ -1.98
SOGA3-201ENST00000465909 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.7□□□□□ -1.98
SOGA3-201ENST00000465909 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.61□□□□□ -1.99
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.54□□□□□ -2
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.49□□□□□ -2.01
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.49□□□□□ -2.01
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.41□□□□□ -2.02
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP5-8O75690 187 aa2.4□□□□□ -2.02
SOGA3-201ENST00000465909 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.94□□□□□ -2.1
SOGA3-201ENST00000465909 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.91□□□□□ -2.1
SOGA3-201ENST00000465909 PHGR1C9JFL3 82 aa1.74□□□□□ -2.13
SOGA3-201ENST00000465909 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.39□□□□□ -2.19
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