RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452802.5

LMCD1-AS1-205, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene LMCD1-AS1, Length 1,387 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.01□□□□□ -1.45
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MT1FP04733 61 aa5.97□□□□□ -1.45
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.97□□□□□ -1.45
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.93□□□□□ -1.46
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PP632Q6XCG6 107 aa5.93□□□□□ -1.46
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP10-10P60014 251 aa5.87□□□□□ -1.47
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PLAC4Q8WY50 150 aa5.84□□□□□ -1.47
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TNP1P09430 55 aa5.81□□□□□ -1.48
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP5-9P26371 169 aa5.79□□□□□ -1.48
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MT1BP07438 61 aa5.78□□□□□ -1.48
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.76□□□□□ -1.49
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.76□□□□□ -1.49
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP10-5P60370 271 aa5.66□□□□□ -1.5
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MT1XP80297 61 aa5.66□□□□□ -1.5
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SPRR2EP22531 72 aa5.53□□□□□ -1.52
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SPRR2BP35325 72 aa5.53□□□□□ -1.52
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SPRR2AP35326 72 aa5.53□□□□□ -1.52
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LCE3AQ5TA76 89 aa5.53□□□□□ -1.52
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.53□□□□□ -1.52
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.52□□□□□ -1.53
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.52□□□□□ -1.53
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.49□□□□□ -1.53
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.48□□□□□ -1.53
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP10-12P60413 245 aa5.42□□□□□ -1.54
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NDUFAF8A1L188 74 aa5.4□□□□□ -1.55
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.37□□□□□ -1.55
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SPRR2DP22532 72 aa5.35□□□□□ -1.55
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP12-3P60328 96 aa5.29□□□□□ -1.56
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LUZP6Q538Z0 58 aa5.25□□□□□ -1.57
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.25□□□□□ -1.57
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.2□□□□□ -1.58
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.15□□□□□ -1.59
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.14□□□□□ -1.59
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.06□□□□□ -1.6
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.06□□□□□ -1.6
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LCE1EQ5T753 118 aa5.05□□□□□ -1.6
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LCE3CQ5T5A8 94 aa5□□□□□ -1.61
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MT1EP04732 61 aa4.93□□□□□ -1.62
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.9□□□□□ -1.63
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MT1LQ93083 61 aa4.89□□□□□ -1.63
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 A0A0A0MQY5 61 aa4.83□□□□□ -1.64
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MT3P25713 68 aa4.82□□□□□ -1.64
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MT4P47944 62 aa4.78□□□□□ -1.64
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.78□□□□□ -1.64
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.77□□□□□ -1.65
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.75□□□□□ -1.65
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.66□□□□□ -1.66
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MT1GP13640 62 aa4.65□□□□□ -1.66
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MT1MQ8N339 61 aa4.61□□□□□ -1.67
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 INE1O15225 51 aa4.55□□□□□ -1.68
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MUC5ACP98088 5654 aa4.49□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.25□□□□□ -1.73
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.24□□□□□ -1.73
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LCE1FQ5T754 118 aa4.22□□□□□ -1.73
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MT1AP04731 61 aa4.16□□□□□ -1.74
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP5-8O75690 187 aa4.12□□□□□ -1.75
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.09□□□□□ -1.75
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.05□□□□□ -1.76
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP12-4P60329 112 aa3.87□□□□□ -1.79
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.78□□□□□ -1.8
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.73□□□□□ -1.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.67□□□□□ -1.82
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PRM1P04553 51 aa3.37□□□□□ -1.87
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LCE1CQ5T751 118 aa3.25□□□□□ -1.89
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.25□□□□□ -1.89
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PHGR1C9JFL3 82 aa3.02□□□□□ -1.93
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.8□□□□□ -1.96
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.72□□□□□ -1.97
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.29□□□□□ -2.04
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 272.5 ms