RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	MT1E	P04732	61 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPRR2D	P22532	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SELENBP1-208	ENST00000447402	MT1L	Q93083	61 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SELENBP1-208	ENST00000447402	MT1G	P13640	62 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	MT1M	Q8N339	61 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SELENBP1-208	ENST00000447402	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.44	□□□□□ -1.7
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.32	□□□□□ -1.72
SELENBP1-208	ENST00000447402	MT4	P47944	62 aa		4.31	□□□□□ -1.72
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.31	□□□□□ -1.72
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.31	□□□□□ -1.72
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	MT1A	P04731	61 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SELENBP1-208	ENST00000447402		H3BS24	57 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SELENBP1-208	ENST00000447402	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SELENBP1-208	ENST00000447402	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SELENBP1-208	ENST00000447402	MT3	P25713	68 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SELENBP1-208	ENST00000447402	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A0A0MQY5	61 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SELENBP1-208	ENST00000447402	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SELENBP1-208	ENST00000447402	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SELENBP1-208	ENST00000447402	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SELENBP1-208	ENST00000447402	INE1	O15225	51 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRM1	P04553	51 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.42	□□□□□ -2.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.23	□□□□□ -2.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.78	□□□□□ -2.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.59	□□□□□ -2.15

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