RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.94□□□□□ -1.46
HCLS1-202ENST00000428394 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.94□□□□□ -1.46
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.93□□□□□ -1.46
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.93□□□□□ -1.46
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.93□□□□□ -1.46
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.92□□□□□ -1.46
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.86□□□□□ -1.47
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.86□□□□□ -1.47
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.86□□□□□ -1.47
HCLS1-202ENST00000428394 MT1LQ93083 61 aa5.81□□□□□ -1.48
HCLS1-202ENST00000428394 MT1EP04732 61 aa5.8□□□□□ -1.48
HCLS1-202ENST00000428394 MDN1Q9NU22 5596 aa5.74□□□□□ -1.49
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP5-9P26371 169 aa5.72□□□□□ -1.49
HCLS1-202ENST00000428394 KMT2DO14686 5537 aa5.71□□□□□ -1.49
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.61□□□□□ -1.51
HCLS1-202ENST00000428394 MT1GP13640 62 aa5.48□□□□□ -1.53
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.47□□□□□ -1.53
HCLS1-202ENST00000428394 SPRR2EP22531 72 aa5.45□□□□□ -1.54
HCLS1-202ENST00000428394 SPRR2BP35325 72 aa5.45□□□□□ -1.54
HCLS1-202ENST00000428394 SPRR2AP35326 72 aa5.45□□□□□ -1.54
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.42□□□□□ -1.54
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HCLS1-202ENST00000428394 MT1MQ8N339 61 aa5.42□□□□□ -1.54
HCLS1-202ENST00000428394 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.33□□□□□ -1.56
HCLS1-202ENST00000428394 SPRR2DP22532 72 aa5.28□□□□□ -1.56
HCLS1-202ENST00000428394 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.27□□□□□ -1.57
HCLS1-202ENST00000428394 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.23□□□□□ -1.57
HCLS1-202ENST00000428394 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.23□□□□□ -1.57
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.22□□□□□ -1.57
HCLS1-202ENST00000428394 LCE3BQ5TA77 95 aa5.17□□□□□ -1.58
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP12-4P60329 112 aa5.12□□□□□ -1.59
HCLS1-202ENST00000428394 MT1AP04731 61 aa5.12□□□□□ -1.59
HCLS1-202ENST00000428394 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.91□□□□□ -1.62
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.85□□□□□ -1.63
HCLS1-202ENST00000428394 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.83□□□□□ -1.64
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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HCLS1-202ENST00000428394 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.77□□□□□ -1.65
HCLS1-202ENST00000428394 LCE1DQ5T752 114 aa4.75□□□□□ -1.65
HCLS1-202ENST00000428394 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.73□□□□□ -1.65
HCLS1-202ENST00000428394 LCE4AQ5TA78 99 aa4.67□□□□□ -1.66
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.65□□□□□ -1.67
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.64□□□□□ -1.67
HCLS1-202ENST00000428394 MT4P47944 62 aa4.63□□□□□ -1.67
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.54□□□□□ -1.68
HCLS1-202ENST00000428394 PRM1P04553 51 aa4.53□□□□□ -1.69
HCLS1-202ENST00000428394 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.48□□□□□ -1.69
HCLS1-202ENST00000428394 MT3P25713 68 aa4.47□□□□□ -1.69
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.46□□□□□ -1.7
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.44□□□□□ -1.7
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.39□□□□□ -1.71
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.25□□□□□ -1.73
HCLS1-202ENST00000428394 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
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HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4□□□□□ -1.77
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HCLS1-202ENST00000428394 MUC5ACP98088 5654 aa3.98□□□□□ -1.77
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HCLS1-202ENST00000428394 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.79□□□□□ -1.8
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.77□□□□□ -1.81
HCLS1-202ENST00000428394 LCE1EQ5T753 118 aa3.72□□□□□ -1.81
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.54□□□□□ -1.84
HCLS1-202ENST00000428394 LCE1CQ5T751 118 aa3.46□□□□□ -1.86
HCLS1-202ENST00000428394 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.46□□□□□ -1.86
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.43□□□□□ -1.86
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.37□□□□□ -1.87
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.18□□□□□ -1.9
HCLS1-202ENST00000428394 LCE1FQ5T754 118 aa2.99□□□□□ -1.93
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.99□□□□□ -1.93
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.98□□□□□ -1.93
HCLS1-202ENST00000428394 PHGR1C9JFL3 82 aa2.72□□□□□ -1.97
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.66□□□□□ -1.98
HCLS1-202ENST00000428394 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.34□□□□□ -2.03
HCLS1-202ENST00000428394 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.72□□□□□ -2.13
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