RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.24□□□□□ -1.57
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.21□□□□□ -1.57
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.21□□□□□ -1.57
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.21□□□□□ -1.57
NISCH-202ENST00000420808 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
NISCH-202ENST00000420808 MT1GP13640 62 aa5.13□□□□□ -1.59
NISCH-202ENST00000420808 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
NISCH-202ENST00000420808 MT1MQ8N339 61 aa5.08□□□□□ -1.6
NISCH-202ENST00000420808 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.08□□□□□ -1.6
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.07□□□□□ -1.6
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.06□□□□□ -1.6
NISCH-202ENST00000420808 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
NISCH-202ENST00000420808 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.98□□□□□ -1.61
NISCH-202ENST00000420808 MDN1Q9NU22 5596 aa4.92□□□□□ -1.62
NISCH-202ENST00000420808 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.91□□□□□ -1.62
NISCH-202ENST00000420808 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
NISCH-202ENST00000420808 LCE3BQ5TA77 95 aa4.73□□□□□ -1.65
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.71□□□□□ -1.66
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.68□□□□□ -1.66
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.65□□□□□ -1.66
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP12-4P60329 112 aa4.64□□□□□ -1.67
NISCH-202ENST00000420808 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.63□□□□□ -1.67
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-9P26371 169 aa4.55□□□□□ -1.68
NISCH-202ENST00000420808 SPRR2EP22531 72 aa4.52□□□□□ -1.69
NISCH-202ENST00000420808 SPRR2BP35325 72 aa4.52□□□□□ -1.69
NISCH-202ENST00000420808 SPRR2AP35326 72 aa4.52□□□□□ -1.69
NISCH-202ENST00000420808 MT1AP04731 61 aa4.5□□□□□ -1.69
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
NISCH-202ENST00000420808 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.45□□□□□ -1.7
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.44□□□□□ -1.7
NISCH-202ENST00000420808 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.34□□□□□ -1.72
NISCH-202ENST00000420808 SPRR2DP22532 72 aa4.3□□□□□ -1.72
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.26□□□□□ -1.73
NISCH-202ENST00000420808 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.25□□□□□ -1.73
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.25□□□□□ -1.73
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.18□□□□□ -1.74
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.15□□□□□ -1.75
NISCH-202ENST00000420808 PRM1P04553 51 aa4.12□□□□□ -1.75
NISCH-202ENST00000420808 MT3P25713 68 aa4.02□□□□□ -1.77
NISCH-202ENST00000420808 NEBP20929 6669 aa3.99□□□□□ -1.77
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.94□□□□□ -1.78
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.93□□□□□ -1.78
NISCH-202ENST00000420808 MT4P47944 62 aa3.89□□□□□ -1.79
NISCH-202ENST00000420808 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.78□□□□□ -1.8
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.74□□□□□ -1.81
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.67□□□□□ -1.82
NISCH-202ENST00000420808 LCE1DQ5T752 114 aa3.63□□□□□ -1.83
NISCH-202ENST00000420808 LCE4AQ5TA78 99 aa3.62□□□□□ -1.83
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.56□□□□□ -1.84
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.56□□□□□ -1.84
NISCH-202ENST00000420808 MUC5ACP98088 5654 aa3.55□□□□□ -1.84
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.46□□□□□ -1.86
NISCH-202ENST00000420808 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.37□□□□□ -1.87
NISCH-202ENST00000420808 LCE1EQ5T753 118 aa3.24□□□□□ -1.89
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.24□□□□□ -1.89
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.21□□□□□ -1.9
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.2□□□□□ -1.9
NISCH-202ENST00000420808 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.19□□□□□ -1.9
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.17□□□□□ -1.9
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.17□□□□□ -1.9
NISCH-202ENST00000420808 LCE1CQ5T751 118 aa3.1□□□□□ -1.91
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.99□□□□□ -1.93
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-8O75690 187 aa2.98□□□□□ -1.93
NISCH-202ENST00000420808 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.95□□□□□ -1.94
NISCH-202ENST00000420808 LCE1FQ5T754 118 aa2.93□□□□□ -1.94
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
NISCH-202ENST00000420808 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.85□□□□□ -1.95
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.82□□□□□ -1.96
NISCH-202ENST00000420808 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.77□□□□□ -1.97
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.71□□□□□ -1.98
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.67□□□□□ -1.98
NISCH-202ENST00000420808 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.52□□□□□ -2.01
NISCH-202ENST00000420808 PHGR1C9JFL3 82 aa2.34□□□□□ -2.04
NISCH-202ENST00000420808 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.57□□□□□ -2.16
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