RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412307.3

C10orf55-202, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene C10orf55, Length 2,360 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-202ENST00000412307 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
C10orf55-202ENST00000412307 MT1LQ93083 61 aa7.41□□□□□ -1.22
C10orf55-202ENST00000412307 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.3□□□□□ -1.24
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.3□□□□□ -1.24
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.17□□□□□ -1.26
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.16□□□□□ -1.26
C10orf55-202ENST00000412307 MDN1Q9NU22 5596 aa7.11□□□□□ -1.27
C10orf55-202ENST00000412307 MT1GP13640 62 aa7.08□□□□□ -1.28
C10orf55-202ENST00000412307 MT1MQ8N339 61 aa7.08□□□□□ -1.28
C10orf55-202ENST00000412307 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.05□□□□□ -1.28
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.04□□□□□ -1.28
C10orf55-202ENST00000412307 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.02□□□□□ -1.29
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-9P26371 169 aa7□□□□□ -1.29
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.97□□□□□ -1.29
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.97□□□□□ -1.29
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.97□□□□□ -1.29
C10orf55-202ENST00000412307 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.96□□□□□ -1.29
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
C10orf55-202ENST00000412307 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.91□□□□□ -1.3
C10orf55-202ENST00000412307 SPRR2EP22531 72 aa6.83□□□□□ -1.32
C10orf55-202ENST00000412307 SPRR2BP35325 72 aa6.83□□□□□ -1.32
C10orf55-202ENST00000412307 SPRR2AP35326 72 aa6.83□□□□□ -1.32
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.76□□□□□ -1.33
C10orf55-202ENST00000412307 SPRR2DP22532 72 aa6.55□□□□□ -1.36
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.5□□□□□ -1.37
C10orf55-202ENST00000412307 NEBP20929 6669 aa6.39□□□□□ -1.39
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.31□□□□□ -1.4
C10orf55-202ENST00000412307 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C10orf55-202ENST00000412307 LCE3BQ5TA77 95 aa6.28□□□□□ -1.4
C10orf55-202ENST00000412307 MT1AP04731 61 aa6.22□□□□□ -1.41
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP12-4P60329 112 aa6.21□□□□□ -1.42
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.06□□□□□ -1.44
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.93□□□□□ -1.46
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.89□□□□□ -1.47
C10orf55-202ENST00000412307 MT4P47944 62 aa5.81□□□□□ -1.48
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.8□□□□□ -1.48
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.78□□□□□ -1.48
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.78□□□□□ -1.48
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.73□□□□□ -1.49
C10orf55-202ENST00000412307 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.73□□□□□ -1.49
C10orf55-202ENST00000412307 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.72□□□□□ -1.49
C10orf55-202ENST00000412307 LCE4AQ5TA78 99 aa5.67□□□□□ -1.5
C10orf55-202ENST00000412307 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.64□□□□□ -1.51
C10orf55-202ENST00000412307 MT3P25713 68 aa5.62□□□□□ -1.51
C10orf55-202ENST00000412307 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.62□□□□□ -1.51
C10orf55-202ENST00000412307 LCE1DQ5T752 114 aa5.6□□□□□ -1.51
C10orf55-202ENST00000412307 PRM1P04553 51 aa5.57□□□□□ -1.52
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.57□□□□□ -1.52
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.37□□□□□ -1.55
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.34□□□□□ -1.56
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.78□□□□□ -1.64
C10orf55-202ENST00000412307 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.76□□□□□ -1.65
C10orf55-202ENST00000412307 LCE1EQ5T753 118 aa4.76□□□□□ -1.65
C10orf55-202ENST00000412307 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.71□□□□□ -1.66
C10orf55-202ENST00000412307 MUC5ACP98088 5654 aa4.7□□□□□ -1.66
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.69□□□□□ -1.66
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-8O75690 187 aa4.6□□□□□ -1.67
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.56□□□□□ -1.68
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.54□□□□□ -1.68
C10orf55-202ENST00000412307 LCE1CQ5T751 118 aa4.48□□□□□ -1.69
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.36□□□□□ -1.71
C10orf55-202ENST00000412307 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.22□□□□□ -1.73
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
C10orf55-202ENST00000412307 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.09□□□□□ -1.75
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.05□□□□□ -1.76
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.91□□□□□ -1.78
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.91□□□□□ -1.78
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.81□□□□□ -1.8
C10orf55-202ENST00000412307 LCE1FQ5T754 118 aa3.78□□□□□ -1.8
C10orf55-202ENST00000412307 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.62□□□□□ -1.83
C10orf55-202ENST00000412307 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
C10orf55-202ENST00000412307 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.43□□□□□ -1.86
C10orf55-202ENST00000412307 PHGR1C9JFL3 82 aa3.4□□□□□ -1.86
C10orf55-202ENST00000412307 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.17□□□□□ -2.06
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