RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-201ENST00000402521 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.27□□□□□ -1.89
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.25□□□□□ -1.89
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.24□□□□□ -1.89
EFTUD2-201ENST00000402521 MDN1Q9NU22 5596 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.21□□□□□ -1.9
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
EFTUD2-201ENST00000402521 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.16□□□□□ -1.9
EFTUD2-201ENST00000402521 MT1EP04732 61 aa3.15□□□□□ -1.91
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.15□□□□□ -1.91
EFTUD2-201ENST00000402521 MT1LQ93083 61 aa3.11□□□□□ -1.91
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-9P26371 169 aa3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-201ENST00000402521 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.05□□□□□ -1.92
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.03□□□□□ -1.92
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.02□□□□□ -1.93
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.01□□□□□ -1.93
EFTUD2-201ENST00000402521 MT1GP13640 62 aa3□□□□□ -1.93
EFTUD2-201ENST00000402521 SPRR2EP22531 72 aa3□□□□□ -1.93
EFTUD2-201ENST00000402521 SPRR2BP35325 72 aa3□□□□□ -1.93
EFTUD2-201ENST00000402521 SPRR2AP35326 72 aa3□□□□□ -1.93
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.98□□□□□ -1.93
EFTUD2-201ENST00000402521 MT1MQ8N339 61 aa2.97□□□□□ -1.93
EFTUD2-201ENST00000402521 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
EFTUD2-201ENST00000402521 NEBP20929 6669 aa2.94□□□□□ -1.94
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP12-4P60329 112 aa2.89□□□□□ -1.95
EFTUD2-201ENST00000402521 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.89□□□□□ -1.95
EFTUD2-201ENST00000402521 SPRR2DP22532 72 aa2.87□□□□□ -1.95
EFTUD2-201ENST00000402521 MT1AP04731 61 aa2.85□□□□□ -1.95
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.81□□□□□ -1.96
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE3BQ5TA77 95 aa2.77□□□□□ -1.97
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.76□□□□□ -1.97
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE4AQ5TA78 99 aa2.71□□□□□ -1.98
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.69□□□□□ -1.98
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.68□□□□□ -1.98
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.68□□□□□ -1.98
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.68□□□□□ -1.98
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.66□□□□□ -1.98
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.62□□□□□ -1.99
EFTUD2-201ENST00000402521 PRM1P04553 51 aa2.58□□□□□ -2
EFTUD2-201ENST00000402521 MT4P47944 62 aa2.56□□□□□ -2
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.56□□□□□ -2
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE1DQ5T752 114 aa2.53□□□□□ -2
EFTUD2-201ENST00000402521 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.53□□□□□ -2.01
EFTUD2-201ENST00000402521 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.5□□□□□ -2.01
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.48□□□□□ -2.01
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.42□□□□□ -2.02
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.39□□□□□ -2.03
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.39□□□□□ -2.03
EFTUD2-201ENST00000402521 MT3P25713 68 aa2.34□□□□□ -2.04
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.34□□□□□ -2.04
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.31□□□□□ -2.04
EFTUD2-201ENST00000402521 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.25□□□□□ -2.05
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.19□□□□□ -2.06
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE1EQ5T753 118 aa2.17□□□□□ -2.06
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.09□□□□□ -2.07
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.08□□□□□ -2.08
EFTUD2-201ENST00000402521 MUC5ACP98088 5654 aa2.07□□□□□ -2.08
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-8O75690 187 aa2.05□□□□□ -2.08
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.04□□□□□ -2.08
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE1FQ5T754 118 aa2.04□□□□□ -2.08
EFTUD2-201ENST00000402521 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
EFTUD2-201ENST00000402521 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE1CQ5T751 118 aa1.89□□□□□ -2.11
EFTUD2-201ENST00000402521 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.8□□□□□ -2.12
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.77□□□□□ -2.13
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.75□□□□□ -2.13
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.71□□□□□ -2.14
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.66□□□□□ -2.14
EFTUD2-201ENST00000402521 PHGR1C9JFL3 82 aa1.45□□□□□ -2.18
EFTUD2-201ENST00000402521 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms